Protein–RNA interactions for Protein: Q61704

Itih3, Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itih3Q61704 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itih3Q61704 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itih3Q61704 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itih3Q61704 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itih3Q61704 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itih3Q61704 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itih3Q61704 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itih3Q61704 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Itih3Q61704 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itih3Q61704 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itih3Q61704 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itih3Q61704 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itih3Q61704 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itih3Q61704 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itih3Q61704 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itih3Q61704 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itih3Q61704 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itih3Q61704 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itih3Q61704 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itih3Q61704 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itih3Q61704 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itih3Q61704 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itih3Q61704 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itih3Q61704 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itih3Q61704 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itih3Q61704 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itih3Q61704 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itih3Q61704 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itih3Q61704 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itih3Q61704 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Itih3Q61704 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itih3Q61704 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itih3Q61704 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itih3Q61704 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itih3Q61704 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itih3Q61704 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itih3Q61704 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itih3Q61704 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itih3Q61704 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itih3Q61704 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itih3Q61704 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itih3Q61704 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itih3Q61704 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itih3Q61704 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itih3Q61704 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itih3Q61704 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itih3Q61704 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itih3Q61704 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itih3Q61704 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itih3Q61704 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itih3Q61704 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itih3Q61704 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itih3Q61704 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itih3Q61704 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itih3Q61704 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itih3Q61704 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Itih3Q61704 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itih3Q61704 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itih3Q61704 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itih3Q61704 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itih3Q61704 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itih3Q61704 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itih3Q61704 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itih3Q61704 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itih3Q61704 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itih3Q61704 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itih3Q61704 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itih3Q61704 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itih3Q61704 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itih3Q61704 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itih3Q61704 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itih3Q61704 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itih3Q61704 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itih3Q61704 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itih3Q61704 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itih3Q61704 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itih3Q61704 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itih3Q61704 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itih3Q61704 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itih3Q61704 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itih3Q61704 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itih3Q61704 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itih3Q61704 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itih3Q61704 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itih3Q61704 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itih3Q61704 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itih3Q61704 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itih3Q61704 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itih3Q61704 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itih3Q61704 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itih3Q61704 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itih3Q61704 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itih3Q61704 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itih3Q61704 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itih3Q61704 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itih3Q61704 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itih3Q61704 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itih3Q61704 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itih3Q61704 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itih3Q61704 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms