Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32,04■■■□□ 2,72
Gli3Q61602 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Gli3Q61602 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC32,04■■■□□ 2,72
Gli3Q61602 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Gli3Q61602 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC32,03■■■□□ 2,72
Gli3Q61602 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC32,03■■■□□ 2,72
Gli3Q61602 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Gli3Q61602 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC32,02■■■□□ 2,72
Gli3Q61602 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Gli3Q61602 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Gli3Q61602 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Gli3Q61602 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32,02■■■□□ 2,72
Gli3Q61602 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,01■■■□□ 2,72
Gli3Q61602 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,01■■■□□ 2,71
Gli3Q61602 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC32,01■■■□□ 2,71
Gli3Q61602 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC32,01■■■□□ 2,71
Gli3Q61602 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,01■■■□□ 2,71
Gli3Q61602 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2,71
Gli3Q61602 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC32■■■□□ 2,71
Gli3Q61602 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2,71
Gli3Q61602 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Gli3Q61602 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31,99■■■□□ 2,71
Gli3Q61602 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC31,99■■■□□ 2,71
Gli3Q61602 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC31,99■■■□□ 2,71
Gli3Q61602 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Gli3Q61602 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC31,98■■■□□ 2,71
Gli3Q61602 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Gli3Q61602 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC31,97■■■□□ 2,71
Gli3Q61602 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC31,97■■■□□ 2,71
Gli3Q61602 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,97■■■□□ 2,71
Gli3Q61602 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC31,96■■■□□ 2,71
Gli3Q61602 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,96■■■□□ 2,71
Gli3Q61602 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,71
Gli3Q61602 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,7
Gli3Q61602 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Gli3Q61602 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Gli3Q61602 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Gli3Q61602 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Gli3Q61602 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,93■■■□□ 2,7
Gli3Q61602 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC31,93■■■□□ 2,7
Gli3Q61602 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,93■■■□□ 2,7
Gli3Q61602 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC31,93■■■□□ 2,7
Gli3Q61602 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC31,92■■■□□ 2,7
Gli3Q61602 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC31,91■■■□□ 2,7
Gli3Q61602 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Gli3Q61602 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Gli3Q61602 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Gli3Q61602 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Gli3Q61602 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Gli3Q61602 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,9■■■□□ 2,7
Gli3Q61602 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC31,9■■■□□ 2,7
Gli3Q61602 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,9■■■□□ 2,7
Gli3Q61602 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,9■■■□□ 2,7
Gli3Q61602 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,89■■■□□ 2,69
Gli3Q61602 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,88■■■□□ 2,69
Gli3Q61602 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
Gli3Q61602 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC31,87■■■□□ 2,69
Gli3Q61602 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,87■■■□□ 2,69
Gli3Q61602 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,87■■■□□ 2,69
Gli3Q61602 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,87■■■□□ 2,69
Gli3Q61602 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,87■■■□□ 2,69
Gli3Q61602 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Gli3Q61602 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
Gli3Q61602 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC31,85■■■□□ 2,69
Gli3Q61602 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC31,85■■■□□ 2,69
Gli3Q61602 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
Gli3Q61602 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,83■■■□□ 2,69
Gli3Q61602 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC31,82■■■□□ 2,68
Gli3Q61602 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,82■■■□□ 2,68
Gli3Q61602 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31,81■■■□□ 2,68
Gli3Q61602 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Gli3Q61602 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Gli3Q61602 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Gli3Q61602 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Gli3Q61602 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Gli3Q61602 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Gli3Q61602 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Gli3Q61602 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Gli3Q61602 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,78■■■□□ 2,68
Gli3Q61602 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC31,78■■■□□ 2,68
Gli3Q61602 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,78■■■□□ 2,68
Gli3Q61602 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31,78■■■□□ 2,68
Gli3Q61602 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
Gli3Q61602 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC31,76■■■□□ 2,67
Gli3Q61602 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC31,76■■■□□ 2,67
Gli3Q61602 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,76■■■□□ 2,67
Gli3Q61602 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,76■■■□□ 2,67
Gli3Q61602 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,74■■■□□ 2,67
Gli3Q61602 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,74■■■□□ 2,67
Gli3Q61602 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC31,73■■■□□ 2,67
Gli3Q61602 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
Gli3Q61602 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
Gli3Q61602 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC31,73■■■□□ 2,67
Gli3Q61602 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Gli3Q61602 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,72■■■□□ 2,67
Gli3Q61602 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Gli3Q61602 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC31,72■■■□□ 2,67
Gli3Q61602 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Gli3Q61602 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Gli3Q61602 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30,6 ms