Protein–RNA interactions for Protein: Q61221

Hif1a, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif1aQ61221 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hif1aQ61221 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hif1aQ61221 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hif1aQ61221 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hif1aQ61221 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hif1aQ61221 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hif1aQ61221 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hif1aQ61221 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hif1aQ61221 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hif1aQ61221 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hif1aQ61221 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hif1aQ61221 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hif1aQ61221 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hif1aQ61221 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hif1aQ61221 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hif1aQ61221 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hif1aQ61221 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hif1aQ61221 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hif1aQ61221 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hif1aQ61221 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hif1aQ61221 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hif1aQ61221 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hif1aQ61221 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hif1aQ61221 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hif1aQ61221 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hif1aQ61221 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hif1aQ61221 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hif1aQ61221 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hif1aQ61221 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hif1aQ61221 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Hif1aQ61221 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hif1aQ61221 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hif1aQ61221 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hif1aQ61221 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hif1aQ61221 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hif1aQ61221 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hif1aQ61221 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hif1aQ61221 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hif1aQ61221 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hif1aQ61221 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hif1aQ61221 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hif1aQ61221 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hif1aQ61221 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hif1aQ61221 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hif1aQ61221 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hif1aQ61221 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hif1aQ61221 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hif1aQ61221 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hif1aQ61221 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hif1aQ61221 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hif1aQ61221 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hif1aQ61221 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hif1aQ61221 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hif1aQ61221 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hif1aQ61221 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hif1aQ61221 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hif1aQ61221 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hif1aQ61221 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Hif1aQ61221 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hif1aQ61221 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hif1aQ61221 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hif1aQ61221 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hif1aQ61221 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hif1aQ61221 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hif1aQ61221 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hif1aQ61221 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hif1aQ61221 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hif1aQ61221 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hif1aQ61221 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hif1aQ61221 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hif1aQ61221 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hif1aQ61221 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hif1aQ61221 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hif1aQ61221 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hif1aQ61221 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hif1aQ61221 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hif1aQ61221 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hif1aQ61221 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hif1aQ61221 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hif1aQ61221 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hif1aQ61221 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Hif1aQ61221 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hif1aQ61221 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hif1aQ61221 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hif1aQ61221 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hif1aQ61221 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hif1aQ61221 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hif1aQ61221 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hif1aQ61221 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hif1aQ61221 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hif1aQ61221 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hif1aQ61221 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hif1aQ61221 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hif1aQ61221 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hif1aQ61221 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hif1aQ61221 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hif1aQ61221 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hif1aQ61221 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hif1aQ61221 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hif1aQ61221 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms