Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Mre11Q61216 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mre11Q61216 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mre11Q61216 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mre11Q61216 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mre11Q61216 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mre11Q61216 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mre11Q61216 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mre11Q61216 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mre11Q61216 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Mre11Q61216 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Mre11Q61216 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Mre11Q61216 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mre11Q61216 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mre11Q61216 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mre11Q61216 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mre11Q61216 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mre11Q61216 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mre11Q61216 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mre11Q61216 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mre11Q61216 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Mre11Q61216 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Mre11Q61216 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Mre11Q61216 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Mre11Q61216 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Mre11Q61216 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mre11Q61216 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mre11Q61216 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mre11Q61216 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mre11Q61216 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mre11Q61216 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mre11Q61216 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Mre11Q61216 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Mre11Q61216 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Mre11Q61216 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mre11Q61216 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mre11Q61216 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mre11Q61216 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mre11Q61216 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Mre11Q61216 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Mre11Q61216 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Mre11Q61216 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Mre11Q61216 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Mre11Q61216 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mre11Q61216 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mre11Q61216 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mre11Q61216 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mre11Q61216 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mre11Q61216 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mre11Q61216 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mre11Q61216 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mre11Q61216 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mre11Q61216 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mre11Q61216 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mre11Q61216 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mre11Q61216 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Mre11Q61216 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Mre11Q61216 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Mre11Q61216 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mre11Q61216 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mre11Q61216 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mre11Q61216 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mre11Q61216 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mre11Q61216 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mre11Q61216 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Mre11Q61216 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mre11Q61216 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mre11Q61216 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Mre11Q61216 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mre11Q61216 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mre11Q61216 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mre11Q61216 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mre11Q61216 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mre11Q61216 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Mre11Q61216 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mre11Q61216 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mre11Q61216 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mre11Q61216 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mre11Q61216 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mre11Q61216 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mre11Q61216 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mre11Q61216 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Mre11Q61216 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mre11Q61216 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mre11Q61216 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mre11Q61216 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mre11Q61216 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mre11Q61216 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Mre11Q61216 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mre11Q61216 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mre11Q61216 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mre11Q61216 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mre11Q61216 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mre11Q61216 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mre11Q61216 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mre11Q61216 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mre11Q61216 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mre11Q61216 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mre11Q61216 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mre11Q61216 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms