Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc9a1Q61165 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc9a1Q61165 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc9a1Q61165 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc9a1Q61165 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc9a1Q61165 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc9a1Q61165 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc9a1Q61165 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc9a1Q61165 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc9a1Q61165 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc9a1Q61165 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc9a1Q61165 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc9a1Q61165 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc9a1Q61165 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc9a1Q61165 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc9a1Q61165 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc9a1Q61165 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc9a1Q61165 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc9a1Q61165 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc9a1Q61165 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc9a1Q61165 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc9a1Q61165 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc9a1Q61165 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc9a1Q61165 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc9a1Q61165 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc9a1Q61165 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc9a1Q61165 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc9a1Q61165 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc9a1Q61165 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc9a1Q61165 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc9a1Q61165 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc9a1Q61165 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc9a1Q61165 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc9a1Q61165 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc9a1Q61165 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc9a1Q61165 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc9a1Q61165 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc9a1Q61165 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc9a1Q61165 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc9a1Q61165 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc9a1Q61165 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc9a1Q61165 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc9a1Q61165 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc9a1Q61165 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc9a1Q61165 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc9a1Q61165 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc9a1Q61165 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc9a1Q61165 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc9a1Q61165 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc9a1Q61165 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc9a1Q61165 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc9a1Q61165 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc9a1Q61165 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc9a1Q61165 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc9a1Q61165 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc9a1Q61165 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc9a1Q61165 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc9a1Q61165 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc9a1Q61165 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc9a1Q61165 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc9a1Q61165 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc9a1Q61165 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc9a1Q61165 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc9a1Q61165 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc9a1Q61165 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc9a1Q61165 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc9a1Q61165 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc9a1Q61165 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc9a1Q61165 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc9a1Q61165 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc9a1Q61165 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc9a1Q61165 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc9a1Q61165 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc9a1Q61165 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc9a1Q61165 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc9a1Q61165 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc9a1Q61165 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc9a1Q61165 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc9a1Q61165 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc9a1Q61165 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc9a1Q61165 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc9a1Q61165 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc9a1Q61165 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc9a1Q61165 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc9a1Q61165 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc9a1Q61165 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc9a1Q61165 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc9a1Q61165 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc9a1Q61165 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc9a1Q61165 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc9a1Q61165 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc9a1Q61165 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc9a1Q61165 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc9a1Q61165 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Slc9a1Q61165 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Slc9a1Q61165 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Slc9a1Q61165 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc9a1Q61165 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc9a1Q61165 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc9a1Q61165 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms