Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbbp4Q60972 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbbp4Q60972 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbbp4Q60972 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbbp4Q60972 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbbp4Q60972 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbbp4Q60972 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbbp4Q60972 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbbp4Q60972 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbbp4Q60972 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbbp4Q60972 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbbp4Q60972 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbbp4Q60972 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rbbp4Q60972 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rbbp4Q60972 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp4Q60972 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp4Q60972 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp4Q60972 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp4Q60972 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbbp4Q60972 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbbp4Q60972 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbbp4Q60972 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbbp4Q60972 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbbp4Q60972 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbbp4Q60972 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbbp4Q60972 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbbp4Q60972 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbbp4Q60972 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbbp4Q60972 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbbp4Q60972 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbbp4Q60972 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbbp4Q60972 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbbp4Q60972 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbbp4Q60972 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbbp4Q60972 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbbp4Q60972 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbbp4Q60972 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbbp4Q60972 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbbp4Q60972 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbbp4Q60972 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbbp4Q60972 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbbp4Q60972 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbbp4Q60972 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbbp4Q60972 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp4Q60972 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp4Q60972 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp4Q60972 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rbbp4Q60972 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rbbp4Q60972 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Rbbp4Q60972 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rbbp4Q60972 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rbbp4Q60972 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rbbp4Q60972 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rbbp4Q60972 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rbbp4Q60972 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rbbp4Q60972 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rbbp4Q60972 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rbbp4Q60972 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rbbp4Q60972 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbbp4Q60972 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbbp4Q60972 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbbp4Q60972 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbbp4Q60972 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rbbp4Q60972 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rbbp4Q60972 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rbbp4Q60972 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rbbp4Q60972 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rbbp4Q60972 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rbbp4Q60972 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbbp4Q60972 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbbp4Q60972 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbbp4Q60972 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbbp4Q60972 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbbp4Q60972 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rbbp4Q60972 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rbbp4Q60972 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rbbp4Q60972 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rbbp4Q60972 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rbbp4Q60972 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rbbp4Q60972 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rbbp4Q60972 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rbbp4Q60972 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbbp4Q60972 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbbp4Q60972 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbbp4Q60972 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbbp4Q60972 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbbp4Q60972 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbbp4Q60972 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbbp4Q60972 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbbp4Q60972 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbbp4Q60972 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbbp4Q60972 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbbp4Q60972 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbbp4Q60972 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbbp4Q60972 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp4Q60972 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp4Q60972 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp4Q60972 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp4Q60972 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp4Q60972 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms