Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdkn2cQ60772 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdkn2cQ60772 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdkn2cQ60772 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdkn2cQ60772 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdkn2cQ60772 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdkn2cQ60772 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdkn2cQ60772 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdkn2cQ60772 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdkn2cQ60772 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdkn2cQ60772 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdkn2cQ60772 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdkn2cQ60772 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdkn2cQ60772 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdkn2cQ60772 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdkn2cQ60772 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdkn2cQ60772 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdkn2cQ60772 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdkn2cQ60772 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdkn2cQ60772 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdkn2cQ60772 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdkn2cQ60772 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdkn2cQ60772 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdkn2cQ60772 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdkn2cQ60772 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdkn2cQ60772 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdkn2cQ60772 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdkn2cQ60772 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdkn2cQ60772 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdkn2cQ60772 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdkn2cQ60772 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdkn2cQ60772 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdkn2cQ60772 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdkn2cQ60772 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdkn2cQ60772 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdkn2cQ60772 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdkn2cQ60772 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdkn2cQ60772 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdkn2cQ60772 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdkn2cQ60772 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdkn2cQ60772 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdkn2cQ60772 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdkn2cQ60772 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdkn2cQ60772 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdkn2cQ60772 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdkn2cQ60772 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdkn2cQ60772 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdkn2cQ60772 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdkn2cQ60772 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdkn2cQ60772 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdkn2cQ60772 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdkn2cQ60772 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdkn2cQ60772 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdkn2cQ60772 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdkn2cQ60772 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdkn2cQ60772 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdkn2cQ60772 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdkn2cQ60772 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdkn2cQ60772 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdkn2cQ60772 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdkn2cQ60772 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdkn2cQ60772 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdkn2cQ60772 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdkn2cQ60772 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdkn2cQ60772 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdkn2cQ60772 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdkn2cQ60772 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdkn2cQ60772 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdkn2cQ60772 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdkn2cQ60772 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdkn2cQ60772 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdkn2cQ60772 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdkn2cQ60772 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdkn2cQ60772 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdkn2cQ60772 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdkn2cQ60772 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdkn2cQ60772 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdkn2cQ60772 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdkn2cQ60772 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdkn2cQ60772 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdkn2cQ60772 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdkn2cQ60772 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdkn2cQ60772 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdkn2cQ60772 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdkn2cQ60772 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdkn2cQ60772 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdkn2cQ60772 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdkn2cQ60772 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdkn2cQ60772 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdkn2cQ60772 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdkn2cQ60772 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdkn2cQ60772 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdkn2cQ60772 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdkn2cQ60772 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdkn2cQ60772 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdkn2cQ60772 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdkn2cQ60772 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdkn2cQ60772 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdkn2cQ60772 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdkn2cQ60772 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms