Protein–RNA interactions for Protein: Q60771

Cldn11, Claudin-11, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn11Q60771 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cldn11Q60771 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cldn11Q60771 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cldn11Q60771 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cldn11Q60771 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cldn11Q60771 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cldn11Q60771 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cldn11Q60771 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cldn11Q60771 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cldn11Q60771 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cldn11Q60771 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cldn11Q60771 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cldn11Q60771 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cldn11Q60771 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cldn11Q60771 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cldn11Q60771 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cldn11Q60771 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cldn11Q60771 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cldn11Q60771 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cldn11Q60771 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cldn11Q60771 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cldn11Q60771 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cldn11Q60771 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cldn11Q60771 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cldn11Q60771 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cldn11Q60771 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cldn11Q60771 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cldn11Q60771 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cldn11Q60771 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cldn11Q60771 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cldn11Q60771 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cldn11Q60771 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cldn11Q60771 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cldn11Q60771 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cldn11Q60771 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cldn11Q60771 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cldn11Q60771 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cldn11Q60771 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cldn11Q60771 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cldn11Q60771 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cldn11Q60771 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cldn11Q60771 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cldn11Q60771 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cldn11Q60771 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cldn11Q60771 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cldn11Q60771 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cldn11Q60771 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cldn11Q60771 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cldn11Q60771 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cldn11Q60771 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cldn11Q60771 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cldn11Q60771 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cldn11Q60771 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cldn11Q60771 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cldn11Q60771 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cldn11Q60771 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cldn11Q60771 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cldn11Q60771 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cldn11Q60771 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cldn11Q60771 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cldn11Q60771 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cldn11Q60771 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cldn11Q60771 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cldn11Q60771 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cldn11Q60771 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cldn11Q60771 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cldn11Q60771 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cldn11Q60771 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cldn11Q60771 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cldn11Q60771 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cldn11Q60771 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cldn11Q60771 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cldn11Q60771 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cldn11Q60771 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cldn11Q60771 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cldn11Q60771 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cldn11Q60771 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cldn11Q60771 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cldn11Q60771 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cldn11Q60771 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cldn11Q60771 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cldn11Q60771 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cldn11Q60771 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cldn11Q60771 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cldn11Q60771 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cldn11Q60771 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cldn11Q60771 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cldn11Q60771 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cldn11Q60771 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cldn11Q60771 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cldn11Q60771 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cldn11Q60771 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cldn11Q60771 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cldn11Q60771 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cldn11Q60771 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cldn11Q60771 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cldn11Q60771 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cldn11Q60771 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cldn11Q60771 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cldn11Q60771 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms