Protein–RNA interactions for Protein: Q60680

Chuk, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChukQ60680 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ChukQ60680 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ChukQ60680 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ChukQ60680 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ChukQ60680 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ChukQ60680 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ChukQ60680 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ChukQ60680 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ChukQ60680 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ChukQ60680 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ChukQ60680 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ChukQ60680 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ChukQ60680 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ChukQ60680 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ChukQ60680 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChukQ60680 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChukQ60680 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChukQ60680 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChukQ60680 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChukQ60680 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChukQ60680 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChukQ60680 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChukQ60680 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChukQ60680 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ChukQ60680 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ChukQ60680 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ChukQ60680 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ChukQ60680 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ChukQ60680 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ChukQ60680 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ChukQ60680 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ChukQ60680 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ChukQ60680 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ChukQ60680 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChukQ60680 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChukQ60680 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChukQ60680 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChukQ60680 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChukQ60680 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChukQ60680 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChukQ60680 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ChukQ60680 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ChukQ60680 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChukQ60680 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChukQ60680 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChukQ60680 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChukQ60680 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChukQ60680 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ChukQ60680 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ChukQ60680 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChukQ60680 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChukQ60680 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ChukQ60680 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ChukQ60680 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChukQ60680 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChukQ60680 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChukQ60680 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChukQ60680 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChukQ60680 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ChukQ60680 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ChukQ60680 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ChukQ60680 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ChukQ60680 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ChukQ60680 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ChukQ60680 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChukQ60680 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChukQ60680 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChukQ60680 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChukQ60680 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChukQ60680 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ChukQ60680 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChukQ60680 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChukQ60680 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChukQ60680 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChukQ60680 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChukQ60680 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChukQ60680 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChukQ60680 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChukQ60680 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChukQ60680 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ChukQ60680 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChukQ60680 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChukQ60680 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChukQ60680 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChukQ60680 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChukQ60680 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChukQ60680 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChukQ60680 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChukQ60680 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChukQ60680 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ChukQ60680 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ChukQ60680 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ChukQ60680 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ChukQ60680 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ChukQ60680 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ChukQ60680 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChukQ60680 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChukQ60680 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChukQ60680 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChukQ60680 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms