Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZT6

Zkscan4, MCG23028, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan4Q5SZT6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zkscan4Q5SZT6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zkscan4Q5SZT6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zkscan4Q5SZT6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zkscan4Q5SZT6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zkscan4Q5SZT6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zkscan4Q5SZT6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zkscan4Q5SZT6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zkscan4Q5SZT6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zkscan4Q5SZT6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zkscan4Q5SZT6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zkscan4Q5SZT6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zkscan4Q5SZT6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Zkscan4Q5SZT6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zkscan4Q5SZT6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Zkscan4Q5SZT6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zkscan4Q5SZT6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zkscan4Q5SZT6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Zkscan4Q5SZT6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zkscan4Q5SZT6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zkscan4Q5SZT6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zkscan4Q5SZT6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zkscan4Q5SZT6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zkscan4Q5SZT6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zkscan4Q5SZT6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zkscan4Q5SZT6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zkscan4Q5SZT6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zkscan4Q5SZT6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zkscan4Q5SZT6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Zkscan4Q5SZT6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zkscan4Q5SZT6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zkscan4Q5SZT6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zkscan4Q5SZT6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zkscan4Q5SZT6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zkscan4Q5SZT6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zkscan4Q5SZT6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zkscan4Q5SZT6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zkscan4Q5SZT6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zkscan4Q5SZT6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zkscan4Q5SZT6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zkscan4Q5SZT6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Zkscan4Q5SZT6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zkscan4Q5SZT6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zkscan4Q5SZT6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zkscan4Q5SZT6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zkscan4Q5SZT6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zkscan4Q5SZT6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zkscan4Q5SZT6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zkscan4Q5SZT6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zkscan4Q5SZT6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Zkscan4Q5SZT6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zkscan4Q5SZT6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zkscan4Q5SZT6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zkscan4Q5SZT6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zkscan4Q5SZT6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zkscan4Q5SZT6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zkscan4Q5SZT6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Zkscan4Q5SZT6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Zkscan4Q5SZT6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zkscan4Q5SZT6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zkscan4Q5SZT6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zkscan4Q5SZT6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zkscan4Q5SZT6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zkscan4Q5SZT6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zkscan4Q5SZT6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zkscan4Q5SZT6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zkscan4Q5SZT6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zkscan4Q5SZT6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zkscan4Q5SZT6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zkscan4Q5SZT6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zkscan4Q5SZT6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zkscan4Q5SZT6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zkscan4Q5SZT6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zkscan4Q5SZT6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Zkscan4Q5SZT6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zkscan4Q5SZT6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zkscan4Q5SZT6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zkscan4Q5SZT6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zkscan4Q5SZT6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zkscan4Q5SZT6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zkscan4Q5SZT6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zkscan4Q5SZT6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zkscan4Q5SZT6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zkscan4Q5SZT6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zkscan4Q5SZT6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zkscan4Q5SZT6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zkscan4Q5SZT6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zkscan4Q5SZT6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zkscan4Q5SZT6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zkscan4Q5SZT6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zkscan4Q5SZT6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zkscan4Q5SZT6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zkscan4Q5SZT6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zkscan4Q5SZT6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zkscan4Q5SZT6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zkscan4Q5SZT6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zkscan4Q5SZT6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zkscan4Q5SZT6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Zkscan4Q5SZT6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zkscan4Q5SZT6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms