Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim38Q5SZ99 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim38Q5SZ99 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim38Q5SZ99 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim38Q5SZ99 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim38Q5SZ99 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim38Q5SZ99 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim38Q5SZ99 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim38Q5SZ99 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim38Q5SZ99 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim38Q5SZ99 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim38Q5SZ99 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim38Q5SZ99 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim38Q5SZ99 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim38Q5SZ99 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim38Q5SZ99 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim38Q5SZ99 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim38Q5SZ99 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim38Q5SZ99 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim38Q5SZ99 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim38Q5SZ99 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim38Q5SZ99 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim38Q5SZ99 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim38Q5SZ99 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim38Q5SZ99 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim38Q5SZ99 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim38Q5SZ99 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim38Q5SZ99 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim38Q5SZ99 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim38Q5SZ99 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim38Q5SZ99 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim38Q5SZ99 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim38Q5SZ99 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Trim38Q5SZ99 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim38Q5SZ99 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim38Q5SZ99 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim38Q5SZ99 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim38Q5SZ99 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim38Q5SZ99 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim38Q5SZ99 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim38Q5SZ99 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim38Q5SZ99 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim38Q5SZ99 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim38Q5SZ99 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim38Q5SZ99 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim38Q5SZ99 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim38Q5SZ99 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim38Q5SZ99 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim38Q5SZ99 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim38Q5SZ99 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim38Q5SZ99 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim38Q5SZ99 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim38Q5SZ99 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim38Q5SZ99 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim38Q5SZ99 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim38Q5SZ99 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim38Q5SZ99 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim38Q5SZ99 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim38Q5SZ99 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim38Q5SZ99 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim38Q5SZ99 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim38Q5SZ99 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim38Q5SZ99 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim38Q5SZ99 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim38Q5SZ99 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim38Q5SZ99 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim38Q5SZ99 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim38Q5SZ99 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim38Q5SZ99 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim38Q5SZ99 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim38Q5SZ99 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim38Q5SZ99 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim38Q5SZ99 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim38Q5SZ99 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim38Q5SZ99 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim38Q5SZ99 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim38Q5SZ99 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim38Q5SZ99 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim38Q5SZ99 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim38Q5SZ99 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim38Q5SZ99 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim38Q5SZ99 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim38Q5SZ99 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim38Q5SZ99 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim38Q5SZ99 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim38Q5SZ99 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim38Q5SZ99 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim38Q5SZ99 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim38Q5SZ99 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim38Q5SZ99 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim38Q5SZ99 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim38Q5SZ99 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim38Q5SZ99 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim38Q5SZ99 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim38Q5SZ99 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim38Q5SZ99 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim38Q5SZ99 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim38Q5SZ99 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim38Q5SZ99 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim38Q5SZ99 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
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