Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r196Q5SVD5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r196Q5SVD5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r196Q5SVD5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r196Q5SVD5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r196Q5SVD5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r196Q5SVD5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r196Q5SVD5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r196Q5SVD5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r196Q5SVD5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r196Q5SVD5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r196Q5SVD5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r196Q5SVD5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r196Q5SVD5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r196Q5SVD5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r196Q5SVD5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r196Q5SVD5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r196Q5SVD5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r196Q5SVD5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r196Q5SVD5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r196Q5SVD5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r196Q5SVD5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r196Q5SVD5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r196Q5SVD5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r196Q5SVD5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r196Q5SVD5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r196Q5SVD5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r196Q5SVD5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r196Q5SVD5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r196Q5SVD5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r196Q5SVD5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r196Q5SVD5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r196Q5SVD5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r196Q5SVD5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r196Q5SVD5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r196Q5SVD5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r196Q5SVD5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r196Q5SVD5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r196Q5SVD5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r196Q5SVD5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r196Q5SVD5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r196Q5SVD5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r196Q5SVD5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r196Q5SVD5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r196Q5SVD5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r196Q5SVD5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r196Q5SVD5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vmn1r196Q5SVD5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r196Q5SVD5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r196Q5SVD5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r196Q5SVD5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r196Q5SVD5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r196Q5SVD5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r196Q5SVD5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r196Q5SVD5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r196Q5SVD5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r196Q5SVD5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r196Q5SVD5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r196Q5SVD5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r196Q5SVD5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r196Q5SVD5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r196Q5SVD5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r196Q5SVD5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r196Q5SVD5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r196Q5SVD5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r196Q5SVD5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r196Q5SVD5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r196Q5SVD5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r196Q5SVD5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r196Q5SVD5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r196Q5SVD5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r196Q5SVD5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r196Q5SVD5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r196Q5SVD5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms