Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUQ9

Ctc1, CST complex subunit CTC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1Q5SUQ9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctc1Q5SUQ9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctc1Q5SUQ9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctc1Q5SUQ9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctc1Q5SUQ9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctc1Q5SUQ9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctc1Q5SUQ9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctc1Q5SUQ9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctc1Q5SUQ9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctc1Q5SUQ9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctc1Q5SUQ9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctc1Q5SUQ9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctc1Q5SUQ9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctc1Q5SUQ9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctc1Q5SUQ9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctc1Q5SUQ9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ctc1Q5SUQ9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ctc1Q5SUQ9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctc1Q5SUQ9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctc1Q5SUQ9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctc1Q5SUQ9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctc1Q5SUQ9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctc1Q5SUQ9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctc1Q5SUQ9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctc1Q5SUQ9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctc1Q5SUQ9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctc1Q5SUQ9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctc1Q5SUQ9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctc1Q5SUQ9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctc1Q5SUQ9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctc1Q5SUQ9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctc1Q5SUQ9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctc1Q5SUQ9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctc1Q5SUQ9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctc1Q5SUQ9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctc1Q5SUQ9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctc1Q5SUQ9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctc1Q5SUQ9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctc1Q5SUQ9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctc1Q5SUQ9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctc1Q5SUQ9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctc1Q5SUQ9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctc1Q5SUQ9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctc1Q5SUQ9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctc1Q5SUQ9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctc1Q5SUQ9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ctc1Q5SUQ9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctc1Q5SUQ9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctc1Q5SUQ9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctc1Q5SUQ9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctc1Q5SUQ9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctc1Q5SUQ9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctc1Q5SUQ9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctc1Q5SUQ9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctc1Q5SUQ9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctc1Q5SUQ9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctc1Q5SUQ9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctc1Q5SUQ9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctc1Q5SUQ9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctc1Q5SUQ9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctc1Q5SUQ9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctc1Q5SUQ9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctc1Q5SUQ9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctc1Q5SUQ9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctc1Q5SUQ9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctc1Q5SUQ9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctc1Q5SUQ9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctc1Q5SUQ9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctc1Q5SUQ9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctc1Q5SUQ9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctc1Q5SUQ9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctc1Q5SUQ9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctc1Q5SUQ9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctc1Q5SUQ9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctc1Q5SUQ9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctc1Q5SUQ9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctc1Q5SUQ9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctc1Q5SUQ9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctc1Q5SUQ9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctc1Q5SUQ9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctc1Q5SUQ9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctc1Q5SUQ9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctc1Q5SUQ9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctc1Q5SUQ9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctc1Q5SUQ9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctc1Q5SUQ9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctc1Q5SUQ9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctc1Q5SUQ9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctc1Q5SUQ9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctc1Q5SUQ9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctc1Q5SUQ9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctc1Q5SUQ9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctc1Q5SUQ9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctc1Q5SUQ9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctc1Q5SUQ9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctc1Q5SUQ9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctc1Q5SUQ9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctc1Q5SUQ9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctc1Q5SUQ9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctc1Q5SUQ9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms