Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ankrd40Q5SUE8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ankrd40Q5SUE8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ankrd40Q5SUE8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ankrd40Q5SUE8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ankrd40Q5SUE8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ankrd40Q5SUE8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ankrd40Q5SUE8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ankrd40Q5SUE8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ankrd40Q5SUE8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ankrd40Q5SUE8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ankrd40Q5SUE8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms