Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ankrd40Q5SUE8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ankrd40Q5SUE8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ankrd40Q5SUE8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ankrd40Q5SUE8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ankrd40Q5SUE8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ankrd40Q5SUE8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ankrd40Q5SUE8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ankrd40Q5SUE8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ankrd40Q5SUE8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ankrd40Q5SUE8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ankrd40Q5SUE8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ankrd40Q5SUE8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ankrd40Q5SUE8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ankrd40Q5SUE8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms