Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Znrf3Q5SSZ7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Znrf3Q5SSZ7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Znrf3Q5SSZ7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Znrf3Q5SSZ7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Znrf3Q5SSZ7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Znrf3Q5SSZ7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Znrf3Q5SSZ7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Znrf3Q5SSZ7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Znrf3Q5SSZ7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Znrf3Q5SSZ7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Znrf3Q5SSZ7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Znrf3Q5SSZ7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Znrf3Q5SSZ7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Znrf3Q5SSZ7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Znrf3Q5SSZ7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znrf3Q5SSZ7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znrf3Q5SSZ7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znrf3Q5SSZ7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Znrf3Q5SSZ7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znrf3Q5SSZ7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znrf3Q5SSZ7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znrf3Q5SSZ7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Znrf3Q5SSZ7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Znrf3Q5SSZ7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znrf3Q5SSZ7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znrf3Q5SSZ7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znrf3Q5SSZ7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znrf3Q5SSZ7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znrf3Q5SSZ7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znrf3Q5SSZ7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znrf3Q5SSZ7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znrf3Q5SSZ7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znrf3Q5SSZ7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znrf3Q5SSZ7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znrf3Q5SSZ7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znrf3Q5SSZ7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Znrf3Q5SSZ7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Znrf3Q5SSZ7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Znrf3Q5SSZ7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Znrf3Q5SSZ7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Znrf3Q5SSZ7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znrf3Q5SSZ7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znrf3Q5SSZ7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znrf3Q5SSZ7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znrf3Q5SSZ7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znrf3Q5SSZ7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znrf3Q5SSZ7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znrf3Q5SSZ7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znrf3Q5SSZ7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znrf3Q5SSZ7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znrf3Q5SSZ7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znrf3Q5SSZ7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znrf3Q5SSZ7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znrf3Q5SSZ7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znrf3Q5SSZ7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znrf3Q5SSZ7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znrf3Q5SSZ7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znrf3Q5SSZ7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znrf3Q5SSZ7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znrf3Q5SSZ7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znrf3Q5SSZ7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znrf3Q5SSZ7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Znrf3Q5SSZ7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Znrf3Q5SSZ7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Znrf3Q5SSZ7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Znrf3Q5SSZ7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Znrf3Q5SSZ7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Znrf3Q5SSZ7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Znrf3Q5SSZ7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Znrf3Q5SSZ7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Znrf3Q5SSZ7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Znrf3Q5SSZ7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Znrf3Q5SSZ7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Znrf3Q5SSZ7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Znrf3Q5SSZ7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Znrf3Q5SSZ7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Znrf3Q5SSZ7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Znrf3Q5SSZ7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Znrf3Q5SSZ7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Znrf3Q5SSZ7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Znrf3Q5SSZ7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Znrf3Q5SSZ7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Znrf3Q5SSZ7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Znrf3Q5SSZ7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Znrf3Q5SSZ7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Znrf3Q5SSZ7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Znrf3Q5SSZ7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Znrf3Q5SSZ7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Znrf3Q5SSZ7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Znrf3Q5SSZ7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Znrf3Q5SSZ7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Znrf3Q5SSZ7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Znrf3Q5SSZ7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Znrf3Q5SSZ7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Znrf3Q5SSZ7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Znrf3Q5SSZ7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Znrf3Q5SSZ7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Znrf3Q5SSZ7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Znrf3Q5SSZ7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms