Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS91

Sun3, SUN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sun3Q5SS91 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sun3Q5SS91 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sun3Q5SS91 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sun3Q5SS91 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sun3Q5SS91 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sun3Q5SS91 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sun3Q5SS91 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sun3Q5SS91 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sun3Q5SS91 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sun3Q5SS91 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sun3Q5SS91 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sun3Q5SS91 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sun3Q5SS91 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sun3Q5SS91 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sun3Q5SS91 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sun3Q5SS91 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sun3Q5SS91 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sun3Q5SS91 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sun3Q5SS91 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sun3Q5SS91 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sun3Q5SS91 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sun3Q5SS91 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Sun3Q5SS91 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sun3Q5SS91 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Sun3Q5SS91 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sun3Q5SS91 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sun3Q5SS91 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sun3Q5SS91 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sun3Q5SS91 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sun3Q5SS91 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sun3Q5SS91 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sun3Q5SS91 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sun3Q5SS91 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sun3Q5SS91 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sun3Q5SS91 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sun3Q5SS91 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sun3Q5SS91 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sun3Q5SS91 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sun3Q5SS91 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sun3Q5SS91 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sun3Q5SS91 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Sun3Q5SS91 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Sun3Q5SS91 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sun3Q5SS91 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sun3Q5SS91 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sun3Q5SS91 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Sun3Q5SS91 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sun3Q5SS91 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Sun3Q5SS91 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sun3Q5SS91 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sun3Q5SS91 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sun3Q5SS91 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sun3Q5SS91 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sun3Q5SS91 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sun3Q5SS91 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Sun3Q5SS91 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sun3Q5SS91 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sun3Q5SS91 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sun3Q5SS91 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sun3Q5SS91 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sun3Q5SS91 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sun3Q5SS91 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Sun3Q5SS91 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sun3Q5SS91 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sun3Q5SS91 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sun3Q5SS91 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sun3Q5SS91 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sun3Q5SS91 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sun3Q5SS91 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sun3Q5SS91 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Sun3Q5SS91 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sun3Q5SS91 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sun3Q5SS91 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sun3Q5SS91 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sun3Q5SS91 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sun3Q5SS91 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sun3Q5SS91 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sun3Q5SS91 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sun3Q5SS91 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sun3Q5SS91 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sun3Q5SS91 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sun3Q5SS91 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sun3Q5SS91 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sun3Q5SS91 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sun3Q5SS91 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sun3Q5SS91 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sun3Q5SS91 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sun3Q5SS91 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sun3Q5SS91 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Sun3Q5SS91 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sun3Q5SS91 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sun3Q5SS91 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sun3Q5SS91 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sun3Q5SS91 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Sun3Q5SS91 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Sun3Q5SS91 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sun3Q5SS91 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Sun3Q5SS91 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sun3Q5SS91 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sun3Q5SS91 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms