Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS00

Zdbf2, DBF4-type zinc finger-containing protein 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zdbf2Q5SS00 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zdbf2Q5SS00 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zdbf2Q5SS00 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zdbf2Q5SS00 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Zdbf2Q5SS00 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zdbf2Q5SS00 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Zdbf2Q5SS00 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zdbf2Q5SS00 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zdbf2Q5SS00 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zdbf2Q5SS00 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zdbf2Q5SS00 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Zdbf2Q5SS00 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zdbf2Q5SS00 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zdbf2Q5SS00 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zdbf2Q5SS00 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Zdbf2Q5SS00 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zdbf2Q5SS00 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zdbf2Q5SS00 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zdbf2Q5SS00 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zdbf2Q5SS00 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zdbf2Q5SS00 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zdbf2Q5SS00 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zdbf2Q5SS00 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zdbf2Q5SS00 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zdbf2Q5SS00 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zdbf2Q5SS00 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zdbf2Q5SS00 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zdbf2Q5SS00 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zdbf2Q5SS00 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zdbf2Q5SS00 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zdbf2Q5SS00 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zdbf2Q5SS00 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Zdbf2Q5SS00 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zdbf2Q5SS00 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zdbf2Q5SS00 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Zdbf2Q5SS00 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zdbf2Q5SS00 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zdbf2Q5SS00 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zdbf2Q5SS00 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zdbf2Q5SS00 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zdbf2Q5SS00 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zdbf2Q5SS00 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zdbf2Q5SS00 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zdbf2Q5SS00 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zdbf2Q5SS00 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zdbf2Q5SS00 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zdbf2Q5SS00 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Zdbf2Q5SS00 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zdbf2Q5SS00 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zdbf2Q5SS00 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zdbf2Q5SS00 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zdbf2Q5SS00 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zdbf2Q5SS00 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zdbf2Q5SS00 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zdbf2Q5SS00 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zdbf2Q5SS00 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zdbf2Q5SS00 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zdbf2Q5SS00 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zdbf2Q5SS00 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zdbf2Q5SS00 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zdbf2Q5SS00 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zdbf2Q5SS00 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zdbf2Q5SS00 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zdbf2Q5SS00 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Zdbf2Q5SS00 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zdbf2Q5SS00 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zdbf2Q5SS00 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zdbf2Q5SS00 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zdbf2Q5SS00 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zdbf2Q5SS00 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zdbf2Q5SS00 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zdbf2Q5SS00 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zdbf2Q5SS00 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Zdbf2Q5SS00 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zdbf2Q5SS00 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zdbf2Q5SS00 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zdbf2Q5SS00 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zdbf2Q5SS00 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zdbf2Q5SS00 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zdbf2Q5SS00 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Zdbf2Q5SS00 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zdbf2Q5SS00 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zdbf2Q5SS00 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zdbf2Q5SS00 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zdbf2Q5SS00 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zdbf2Q5SS00 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zdbf2Q5SS00 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zdbf2Q5SS00 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zdbf2Q5SS00 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zdbf2Q5SS00 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zdbf2Q5SS00 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zdbf2Q5SS00 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zdbf2Q5SS00 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zdbf2Q5SS00 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zdbf2Q5SS00 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zdbf2Q5SS00 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zdbf2Q5SS00 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zdbf2Q5SS00 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zdbf2Q5SS00 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zdbf2Q5SS00 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms