Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bhlha9Q5RJB0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bhlha9Q5RJB0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bhlha9Q5RJB0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bhlha9Q5RJB0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bhlha9Q5RJB0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bhlha9Q5RJB0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bhlha9Q5RJB0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bhlha9Q5RJB0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bhlha9Q5RJB0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bhlha9Q5RJB0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bhlha9Q5RJB0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bhlha9Q5RJB0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bhlha9Q5RJB0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bhlha9Q5RJB0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bhlha9Q5RJB0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bhlha9Q5RJB0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bhlha9Q5RJB0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bhlha9Q5RJB0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bhlha9Q5RJB0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bhlha9Q5RJB0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bhlha9Q5RJB0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bhlha9Q5RJB0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bhlha9Q5RJB0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bhlha9Q5RJB0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bhlha9Q5RJB0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bhlha9Q5RJB0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bhlha9Q5RJB0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bhlha9Q5RJB0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bhlha9Q5RJB0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Bhlha9Q5RJB0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bhlha9Q5RJB0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bhlha9Q5RJB0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bhlha9Q5RJB0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bhlha9Q5RJB0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bhlha9Q5RJB0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bhlha9Q5RJB0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bhlha9Q5RJB0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bhlha9Q5RJB0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bhlha9Q5RJB0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bhlha9Q5RJB0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bhlha9Q5RJB0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bhlha9Q5RJB0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bhlha9Q5RJB0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bhlha9Q5RJB0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bhlha9Q5RJB0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bhlha9Q5RJB0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bhlha9Q5RJB0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bhlha9Q5RJB0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bhlha9Q5RJB0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bhlha9Q5RJB0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bhlha9Q5RJB0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Bhlha9Q5RJB0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bhlha9Q5RJB0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bhlha9Q5RJB0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bhlha9Q5RJB0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bhlha9Q5RJB0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bhlha9Q5RJB0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bhlha9Q5RJB0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bhlha9Q5RJB0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bhlha9Q5RJB0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bhlha9Q5RJB0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bhlha9Q5RJB0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bhlha9Q5RJB0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bhlha9Q5RJB0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bhlha9Q5RJB0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bhlha9Q5RJB0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Bhlha9Q5RJB0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bhlha9Q5RJB0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bhlha9Q5RJB0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Bhlha9Q5RJB0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bhlha9Q5RJB0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bhlha9Q5RJB0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bhlha9Q5RJB0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bhlha9Q5RJB0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bhlha9Q5RJB0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bhlha9Q5RJB0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bhlha9Q5RJB0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Bhlha9Q5RJB0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bhlha9Q5RJB0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bhlha9Q5RJB0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Bhlha9Q5RJB0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bhlha9Q5RJB0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bhlha9Q5RJB0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bhlha9Q5RJB0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bhlha9Q5RJB0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bhlha9Q5RJB0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bhlha9Q5RJB0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bhlha9Q5RJB0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bhlha9Q5RJB0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bhlha9Q5RJB0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bhlha9Q5RJB0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Bhlha9Q5RJB0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bhlha9Q5RJB0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bhlha9Q5RJB0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bhlha9Q5RJB0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bhlha9Q5RJB0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bhlha9Q5RJB0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bhlha9Q5RJB0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bhlha9Q5RJB0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms