Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttf2Q5NC05 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttf2Q5NC05 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttf2Q5NC05 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttf2Q5NC05 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ttf2Q5NC05 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ttf2Q5NC05 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ttf2Q5NC05 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ttf2Q5NC05 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ttf2Q5NC05 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ttf2Q5NC05 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ttf2Q5NC05 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ttf2Q5NC05 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ttf2Q5NC05 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttf2Q5NC05 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttf2Q5NC05 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttf2Q5NC05 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttf2Q5NC05 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttf2Q5NC05 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttf2Q5NC05 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttf2Q5NC05 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttf2Q5NC05 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttf2Q5NC05 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttf2Q5NC05 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttf2Q5NC05 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttf2Q5NC05 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttf2Q5NC05 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttf2Q5NC05 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttf2Q5NC05 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttf2Q5NC05 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttf2Q5NC05 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ttf2Q5NC05 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ttf2Q5NC05 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ttf2Q5NC05 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ttf2Q5NC05 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ttf2Q5NC05 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ttf2Q5NC05 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ttf2Q5NC05 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ttf2Q5NC05 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttf2Q5NC05 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttf2Q5NC05 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttf2Q5NC05 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttf2Q5NC05 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttf2Q5NC05 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttf2Q5NC05 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttf2Q5NC05 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttf2Q5NC05 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttf2Q5NC05 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttf2Q5NC05 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttf2Q5NC05 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttf2Q5NC05 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttf2Q5NC05 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttf2Q5NC05 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttf2Q5NC05 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttf2Q5NC05 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttf2Q5NC05 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttf2Q5NC05 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttf2Q5NC05 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttf2Q5NC05 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttf2Q5NC05 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ttf2Q5NC05 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ttf2Q5NC05 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ttf2Q5NC05 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ttf2Q5NC05 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ttf2Q5NC05 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ttf2Q5NC05 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ttf2Q5NC05 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttf2Q5NC05 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttf2Q5NC05 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttf2Q5NC05 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttf2Q5NC05 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttf2Q5NC05 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttf2Q5NC05 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttf2Q5NC05 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttf2Q5NC05 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttf2Q5NC05 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttf2Q5NC05 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttf2Q5NC05 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttf2Q5NC05 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttf2Q5NC05 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttf2Q5NC05 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttf2Q5NC05 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttf2Q5NC05 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttf2Q5NC05 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttf2Q5NC05 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttf2Q5NC05 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttf2Q5NC05 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttf2Q5NC05 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttf2Q5NC05 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttf2Q5NC05 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttf2Q5NC05 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttf2Q5NC05 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttf2Q5NC05 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttf2Q5NC05 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttf2Q5NC05 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttf2Q5NC05 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttf2Q5NC05 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttf2Q5NC05 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttf2Q5NC05 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttf2Q5NC05 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms