Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3558Q5FWC9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3558Q5FWC9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3558Q5FWC9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3558Q5FWC9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3558Q5FWC9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3558Q5FWC9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3558Q5FWC9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3558Q5FWC9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3558Q5FWC9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3558Q5FWC9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3558Q5FWC9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3558Q5FWC9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3558Q5FWC9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3558Q5FWC9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3558Q5FWC9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3558Q5FWC9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3558Q5FWC9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3558Q5FWC9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3558Q5FWC9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm3558Q5FWC9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm3558Q5FWC9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm3558Q5FWC9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3558Q5FWC9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3558Q5FWC9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3558Q5FWC9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3558Q5FWC9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3558Q5FWC9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3558Q5FWC9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3558Q5FWC9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3558Q5FWC9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3558Q5FWC9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3558Q5FWC9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3558Q5FWC9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3558Q5FWC9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3558Q5FWC9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3558Q5FWC9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3558Q5FWC9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3558Q5FWC9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3558Q5FWC9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3558Q5FWC9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3558Q5FWC9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3558Q5FWC9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3558Q5FWC9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3558Q5FWC9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3558Q5FWC9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3558Q5FWC9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3558Q5FWC9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3558Q5FWC9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3558Q5FWC9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3558Q5FWC9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3558Q5FWC9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3558Q5FWC9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3558Q5FWC9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3558Q5FWC9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3558Q5FWC9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3558Q5FWC9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm3558Q5FWC9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3558Q5FWC9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3558Q5FWC9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3558Q5FWC9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3558Q5FWC9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3558Q5FWC9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3558Q5FWC9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3558Q5FWC9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3558Q5FWC9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3558Q5FWC9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3558Q5FWC9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3558Q5FWC9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3558Q5FWC9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3558Q5FWC9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3558Q5FWC9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3558Q5FWC9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3558Q5FWC9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3558Q5FWC9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3558Q5FWC9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3558Q5FWC9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3558Q5FWC9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3558Q5FWC9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3558Q5FWC9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3558Q5FWC9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3558Q5FWC9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3558Q5FWC9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3558Q5FWC9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm3558Q5FWC9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3558Q5FWC9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3558Q5FWC9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3558Q5FWC9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3558Q5FWC9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3558Q5FWC9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3558Q5FWC9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3558Q5FWC9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3558Q5FWC9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3558Q5FWC9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3558Q5FWC9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3558Q5FWC9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3558Q5FWC9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3558Q5FWC9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3558Q5FWC9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3558Q5FWC9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms