Protein–RNA interactions for Protein: Q56A07

Scn2b, Sodium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2bQ56A07 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scn2bQ56A07 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scn2bQ56A07 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scn2bQ56A07 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scn2bQ56A07 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scn2bQ56A07 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scn2bQ56A07 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scn2bQ56A07 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scn2bQ56A07 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scn2bQ56A07 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scn2bQ56A07 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scn2bQ56A07 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scn2bQ56A07 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn2bQ56A07 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn2bQ56A07 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn2bQ56A07 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn2bQ56A07 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn2bQ56A07 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scn2bQ56A07 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scn2bQ56A07 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scn2bQ56A07 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn2bQ56A07 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn2bQ56A07 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn2bQ56A07 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn2bQ56A07 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn2bQ56A07 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn2bQ56A07 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn2bQ56A07 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn2bQ56A07 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn2bQ56A07 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn2bQ56A07 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn2bQ56A07 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn2bQ56A07 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn2bQ56A07 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn2bQ56A07 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn2bQ56A07 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn2bQ56A07 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn2bQ56A07 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn2bQ56A07 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn2bQ56A07 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn2bQ56A07 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn2bQ56A07 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn2bQ56A07 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn2bQ56A07 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn2bQ56A07 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn2bQ56A07 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn2bQ56A07 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn2bQ56A07 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn2bQ56A07 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn2bQ56A07 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn2bQ56A07 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn2bQ56A07 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn2bQ56A07 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn2bQ56A07 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn2bQ56A07 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scn2bQ56A07 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scn2bQ56A07 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn2bQ56A07 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn2bQ56A07 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn2bQ56A07 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn2bQ56A07 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn2bQ56A07 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn2bQ56A07 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn2bQ56A07 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn2bQ56A07 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn2bQ56A07 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn2bQ56A07 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn2bQ56A07 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn2bQ56A07 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn2bQ56A07 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn2bQ56A07 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn2bQ56A07 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn2bQ56A07 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn2bQ56A07 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn2bQ56A07 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn2bQ56A07 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn2bQ56A07 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn2bQ56A07 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn2bQ56A07 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn2bQ56A07 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn2bQ56A07 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn2bQ56A07 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scn2bQ56A07 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn2bQ56A07 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn2bQ56A07 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn2bQ56A07 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn2bQ56A07 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn2bQ56A07 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn2bQ56A07 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn2bQ56A07 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn2bQ56A07 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn2bQ56A07 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn2bQ56A07 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn2bQ56A07 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn2bQ56A07 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn2bQ56A07 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn2bQ56A07 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn2bQ56A07 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn2bQ56A07 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn2bQ56A07 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms