Protein–RNA interactions for Protein: Q4LFA9

Sema3g, Semaphorin-3G, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3gQ4LFA9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema3gQ4LFA9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema3gQ4LFA9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema3gQ4LFA9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema3gQ4LFA9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema3gQ4LFA9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema3gQ4LFA9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema3gQ4LFA9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema3gQ4LFA9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema3gQ4LFA9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema3gQ4LFA9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema3gQ4LFA9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema3gQ4LFA9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema3gQ4LFA9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema3gQ4LFA9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema3gQ4LFA9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema3gQ4LFA9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema3gQ4LFA9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3gQ4LFA9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3gQ4LFA9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3gQ4LFA9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3gQ4LFA9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3gQ4LFA9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3gQ4LFA9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3gQ4LFA9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema3gQ4LFA9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema3gQ4LFA9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3gQ4LFA9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3gQ4LFA9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3gQ4LFA9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3gQ4LFA9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sema3gQ4LFA9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sema3gQ4LFA9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema3gQ4LFA9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema3gQ4LFA9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema3gQ4LFA9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema3gQ4LFA9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema3gQ4LFA9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema3gQ4LFA9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema3gQ4LFA9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema3gQ4LFA9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema3gQ4LFA9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema3gQ4LFA9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema3gQ4LFA9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema3gQ4LFA9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema3gQ4LFA9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema3gQ4LFA9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema3gQ4LFA9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3gQ4LFA9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3gQ4LFA9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3gQ4LFA9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3gQ4LFA9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3gQ4LFA9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3gQ4LFA9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sema3gQ4LFA9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema3gQ4LFA9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema3gQ4LFA9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema3gQ4LFA9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema3gQ4LFA9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema3gQ4LFA9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema3gQ4LFA9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema3gQ4LFA9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema3gQ4LFA9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema3gQ4LFA9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema3gQ4LFA9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema3gQ4LFA9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema3gQ4LFA9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema3gQ4LFA9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema3gQ4LFA9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3gQ4LFA9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3gQ4LFA9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3gQ4LFA9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3gQ4LFA9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3gQ4LFA9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema3gQ4LFA9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema3gQ4LFA9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema3gQ4LFA9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema3gQ4LFA9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema3gQ4LFA9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema3gQ4LFA9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema3gQ4LFA9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema3gQ4LFA9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema3gQ4LFA9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema3gQ4LFA9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema3gQ4LFA9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema3gQ4LFA9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema3gQ4LFA9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema3gQ4LFA9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sema3gQ4LFA9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema3gQ4LFA9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema3gQ4LFA9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema3gQ4LFA9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema3gQ4LFA9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema3gQ4LFA9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema3gQ4LFA9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema3gQ4LFA9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema3gQ4LFA9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema3gQ4LFA9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema3gQ4LFA9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema3gQ4LFA9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms