Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3R4

Itga1, Integrin alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga1Q3V3R4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga1Q3V3R4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga1Q3V3R4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga1Q3V3R4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itga1Q3V3R4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itga1Q3V3R4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itga1Q3V3R4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itga1Q3V3R4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itga1Q3V3R4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga1Q3V3R4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga1Q3V3R4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga1Q3V3R4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga1Q3V3R4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itga1Q3V3R4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itga1Q3V3R4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itga1Q3V3R4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itga1Q3V3R4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itga1Q3V3R4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga1Q3V3R4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga1Q3V3R4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga1Q3V3R4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga1Q3V3R4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga1Q3V3R4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga1Q3V3R4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga1Q3V3R4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itga1Q3V3R4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Itga1Q3V3R4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Itga1Q3V3R4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itga1Q3V3R4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itga1Q3V3R4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Itga1Q3V3R4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itga1Q3V3R4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Itga1Q3V3R4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itga1Q3V3R4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga1Q3V3R4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga1Q3V3R4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga1Q3V3R4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga1Q3V3R4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga1Q3V3R4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga1Q3V3R4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga1Q3V3R4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga1Q3V3R4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga1Q3V3R4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga1Q3V3R4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga1Q3V3R4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga1Q3V3R4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga1Q3V3R4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga1Q3V3R4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itga1Q3V3R4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itga1Q3V3R4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itga1Q3V3R4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itga1Q3V3R4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Itga1Q3V3R4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itga1Q3V3R4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itga1Q3V3R4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itga1Q3V3R4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Itga1Q3V3R4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itga1Q3V3R4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itga1Q3V3R4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itga1Q3V3R4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itga1Q3V3R4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga1Q3V3R4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga1Q3V3R4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga1Q3V3R4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga1Q3V3R4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga1Q3V3R4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga1Q3V3R4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga1Q3V3R4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itga1Q3V3R4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Itga1Q3V3R4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itga1Q3V3R4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itga1Q3V3R4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itga1Q3V3R4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Itga1Q3V3R4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itga1Q3V3R4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itga1Q3V3R4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Itga1Q3V3R4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itga1Q3V3R4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itga1Q3V3R4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itga1Q3V3R4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itga1Q3V3R4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga1Q3V3R4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga1Q3V3R4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga1Q3V3R4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga1Q3V3R4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga1Q3V3R4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga1Q3V3R4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga1Q3V3R4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga1Q3V3R4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga1Q3V3R4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga1Q3V3R4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga1Q3V3R4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga1Q3V3R4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga1Q3V3R4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga1Q3V3R4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga1Q3V3R4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga1Q3V3R4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga1Q3V3R4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga1Q3V3R4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga1Q3V3R4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms