Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pacs2Q3V3Q7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pacs2Q3V3Q7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pacs2Q3V3Q7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pacs2Q3V3Q7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pacs2Q3V3Q7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pacs2Q3V3Q7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pacs2Q3V3Q7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pacs2Q3V3Q7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pacs2Q3V3Q7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pacs2Q3V3Q7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pacs2Q3V3Q7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pacs2Q3V3Q7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pacs2Q3V3Q7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pacs2Q3V3Q7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pacs2Q3V3Q7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pacs2Q3V3Q7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pacs2Q3V3Q7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pacs2Q3V3Q7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pacs2Q3V3Q7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pacs2Q3V3Q7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pacs2Q3V3Q7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pacs2Q3V3Q7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pacs2Q3V3Q7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pacs2Q3V3Q7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pacs2Q3V3Q7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pacs2Q3V3Q7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pacs2Q3V3Q7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pacs2Q3V3Q7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pacs2Q3V3Q7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pacs2Q3V3Q7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pacs2Q3V3Q7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pacs2Q3V3Q7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pacs2Q3V3Q7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pacs2Q3V3Q7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Pacs2Q3V3Q7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pacs2Q3V3Q7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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