Protein–RNA interactions for Protein: Q3V384

Afg1l, AFG1-like ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg1lQ3V384 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Afg1lQ3V384 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Afg1lQ3V384 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Afg1lQ3V384 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Afg1lQ3V384 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Afg1lQ3V384 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Afg1lQ3V384 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Afg1lQ3V384 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Afg1lQ3V384 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Afg1lQ3V384 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Afg1lQ3V384 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Afg1lQ3V384 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Afg1lQ3V384 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Afg1lQ3V384 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Afg1lQ3V384 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Afg1lQ3V384 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Afg1lQ3V384 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Afg1lQ3V384 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Afg1lQ3V384 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Afg1lQ3V384 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Afg1lQ3V384 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Afg1lQ3V384 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Afg1lQ3V384 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Afg1lQ3V384 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Afg1lQ3V384 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Afg1lQ3V384 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Afg1lQ3V384 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Afg1lQ3V384 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Afg1lQ3V384 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Afg1lQ3V384 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Afg1lQ3V384 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Afg1lQ3V384 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Afg1lQ3V384 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Afg1lQ3V384 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Afg1lQ3V384 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Afg1lQ3V384 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Afg1lQ3V384 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Afg1lQ3V384 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Afg1lQ3V384 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Afg1lQ3V384 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Afg1lQ3V384 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Afg1lQ3V384 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Afg1lQ3V384 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Afg1lQ3V384 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Afg1lQ3V384 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Afg1lQ3V384 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Afg1lQ3V384 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Afg1lQ3V384 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Afg1lQ3V384 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Afg1lQ3V384 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Afg1lQ3V384 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Afg1lQ3V384 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Afg1lQ3V384 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Afg1lQ3V384 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Afg1lQ3V384 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Afg1lQ3V384 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Afg1lQ3V384 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Afg1lQ3V384 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Afg1lQ3V384 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Afg1lQ3V384 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Afg1lQ3V384 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Afg1lQ3V384 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Afg1lQ3V384 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Afg1lQ3V384 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Afg1lQ3V384 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Afg1lQ3V384 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Afg1lQ3V384 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Afg1lQ3V384 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Afg1lQ3V384 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Afg1lQ3V384 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Afg1lQ3V384 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Afg1lQ3V384 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Afg1lQ3V384 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Afg1lQ3V384 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Afg1lQ3V384 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Afg1lQ3V384 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Afg1lQ3V384 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Afg1lQ3V384 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Afg1lQ3V384 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Afg1lQ3V384 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Afg1lQ3V384 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Afg1lQ3V384 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Afg1lQ3V384 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Afg1lQ3V384 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Afg1lQ3V384 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Afg1lQ3V384 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Afg1lQ3V384 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Afg1lQ3V384 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Afg1lQ3V384 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Afg1lQ3V384 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Afg1lQ3V384 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Afg1lQ3V384 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Afg1lQ3V384 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Afg1lQ3V384 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Afg1lQ3V384 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Afg1lQ3V384 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Afg1lQ3V384 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Afg1lQ3V384 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Afg1lQ3V384 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Afg1lQ3V384 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms