Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q3V0E1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q3V0E1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q3V0E1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q3V0E1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q3V0E1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3V0E1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3V0E1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3V0E1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3V0E1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3V0E1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3V0E1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3V0E1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3V0E1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q3V0E1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q3V0E1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q3V0E1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q3V0E1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q3V0E1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q3V0E1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q3V0E1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q3V0E1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3V0E1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3V0E1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3V0E1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q3V0E1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q3V0E1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q3V0E1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q3V0E1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Q3V0E1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q3V0E1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3V0E1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3V0E1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3V0E1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3V0E1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3V0E1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3V0E1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3V0E1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3V0E1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3V0E1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3V0E1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3V0E1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q3V0E1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Q3V0E1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q3V0E1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q3V0E1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q3V0E1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q3V0E1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3V0E1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3V0E1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3V0E1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3V0E1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3V0E1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3V0E1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Q3V0E1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q3V0E1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q3V0E1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q3V0E1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q3V0E1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q3V0E1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q3V0E1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q3V0E1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q3V0E1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q3V0E1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q3V0E1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q3V0E1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q3V0E1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q3V0E1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q3V0E1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q3V0E1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q3V0E1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q3V0E1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3V0E1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3V0E1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3V0E1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3V0E1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3V0E1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3V0E1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3V0E1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3V0E1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q3V0E1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Q3V0E1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q3V0E1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q3V0E1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q3V0E1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q3V0E1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q3V0E1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q3V0E1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q3V0E1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q3V0E1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q3V0E1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q3V0E1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Q3V0E1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q3V0E1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q3V0E1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q3V0E1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q3V0E1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q3V0E1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q3V0E1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q3V0E1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms