Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C1

Zmat1, Zinc finger matrin-type protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat1Q3V0C1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zmat1Q3V0C1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zmat1Q3V0C1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zmat1Q3V0C1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zmat1Q3V0C1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zmat1Q3V0C1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zmat1Q3V0C1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zmat1Q3V0C1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zmat1Q3V0C1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zmat1Q3V0C1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Zmat1Q3V0C1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zmat1Q3V0C1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Zmat1Q3V0C1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zmat1Q3V0C1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zmat1Q3V0C1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zmat1Q3V0C1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zmat1Q3V0C1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zmat1Q3V0C1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zmat1Q3V0C1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zmat1Q3V0C1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zmat1Q3V0C1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zmat1Q3V0C1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zmat1Q3V0C1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zmat1Q3V0C1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zmat1Q3V0C1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zmat1Q3V0C1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zmat1Q3V0C1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zmat1Q3V0C1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zmat1Q3V0C1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zmat1Q3V0C1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zmat1Q3V0C1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zmat1Q3V0C1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zmat1Q3V0C1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zmat1Q3V0C1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zmat1Q3V0C1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zmat1Q3V0C1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zmat1Q3V0C1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zmat1Q3V0C1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zmat1Q3V0C1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zmat1Q3V0C1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zmat1Q3V0C1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zmat1Q3V0C1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zmat1Q3V0C1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zmat1Q3V0C1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zmat1Q3V0C1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zmat1Q3V0C1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zmat1Q3V0C1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zmat1Q3V0C1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zmat1Q3V0C1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Zmat1Q3V0C1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zmat1Q3V0C1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zmat1Q3V0C1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zmat1Q3V0C1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zmat1Q3V0C1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zmat1Q3V0C1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zmat1Q3V0C1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zmat1Q3V0C1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zmat1Q3V0C1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zmat1Q3V0C1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zmat1Q3V0C1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zmat1Q3V0C1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zmat1Q3V0C1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zmat1Q3V0C1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Zmat1Q3V0C1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zmat1Q3V0C1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zmat1Q3V0C1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zmat1Q3V0C1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zmat1Q3V0C1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zmat1Q3V0C1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zmat1Q3V0C1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zmat1Q3V0C1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zmat1Q3V0C1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zmat1Q3V0C1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zmat1Q3V0C1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zmat1Q3V0C1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zmat1Q3V0C1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zmat1Q3V0C1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zmat1Q3V0C1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zmat1Q3V0C1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zmat1Q3V0C1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zmat1Q3V0C1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Zmat1Q3V0C1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zmat1Q3V0C1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Zmat1Q3V0C1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Zmat1Q3V0C1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zmat1Q3V0C1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zmat1Q3V0C1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zmat1Q3V0C1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zmat1Q3V0C1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zmat1Q3V0C1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zmat1Q3V0C1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zmat1Q3V0C1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zmat1Q3V0C1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zmat1Q3V0C1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Zmat1Q3V0C1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Zmat1Q3V0C1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zmat1Q3V0C1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Zmat1Q3V0C1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zmat1Q3V0C1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zmat1Q3V0C1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms