Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SvipQ3UZP4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SvipQ3UZP4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SvipQ3UZP4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SvipQ3UZP4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SvipQ3UZP4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SvipQ3UZP4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SvipQ3UZP4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SvipQ3UZP4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SvipQ3UZP4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SvipQ3UZP4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SvipQ3UZP4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvipQ3UZP4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvipQ3UZP4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvipQ3UZP4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvipQ3UZP4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvipQ3UZP4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvipQ3UZP4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SvipQ3UZP4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SvipQ3UZP4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SvipQ3UZP4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SvipQ3UZP4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SvipQ3UZP4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SvipQ3UZP4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
SvipQ3UZP4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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