Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C87499Q3UX49 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C87499Q3UX49 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C87499Q3UX49 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C87499Q3UX49 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C87499Q3UX49 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C87499Q3UX49 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C87499Q3UX49 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C87499Q3UX49 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C87499Q3UX49 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
C87499Q3UX49 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C87499Q3UX49 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C87499Q3UX49 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C87499Q3UX49 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C87499Q3UX49 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C87499Q3UX49 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C87499Q3UX49 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C87499Q3UX49 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
C87499Q3UX49 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C87499Q3UX49 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C87499Q3UX49 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
C87499Q3UX49 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
C87499Q3UX49 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C87499Q3UX49 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C87499Q3UX49 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C87499Q3UX49 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C87499Q3UX49 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C87499Q3UX49 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C87499Q3UX49 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C87499Q3UX49 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
C87499Q3UX49 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C87499Q3UX49 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C87499Q3UX49 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C87499Q3UX49 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C87499Q3UX49 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C87499Q3UX49 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C87499Q3UX49 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C87499Q3UX49 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C87499Q3UX49 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C87499Q3UX49 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C87499Q3UX49 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C87499Q3UX49 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C87499Q3UX49 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C87499Q3UX49 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C87499Q3UX49 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C87499Q3UX49 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
C87499Q3UX49 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C87499Q3UX49 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C87499Q3UX49 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C87499Q3UX49 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C87499Q3UX49 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C87499Q3UX49 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C87499Q3UX49 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C87499Q3UX49 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C87499Q3UX49 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
C87499Q3UX49 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C87499Q3UX49 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C87499Q3UX49 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
C87499Q3UX49 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C87499Q3UX49 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C87499Q3UX49 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C87499Q3UX49 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C87499Q3UX49 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C87499Q3UX49 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C87499Q3UX49 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C87499Q3UX49 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C87499Q3UX49 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C87499Q3UX49 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C87499Q3UX49 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
C87499Q3UX49 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C87499Q3UX49 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C87499Q3UX49 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C87499Q3UX49 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C87499Q3UX49 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C87499Q3UX49 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C87499Q3UX49 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C87499Q3UX49 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C87499Q3UX49 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C87499Q3UX49 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C87499Q3UX49 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C87499Q3UX49 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C87499Q3UX49 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
C87499Q3UX49 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C87499Q3UX49 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C87499Q3UX49 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C87499Q3UX49 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C87499Q3UX49 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C87499Q3UX49 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C87499Q3UX49 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C87499Q3UX49 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C87499Q3UX49 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C87499Q3UX49 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C87499Q3UX49 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C87499Q3UX49 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C87499Q3UX49 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
C87499Q3UX49 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C87499Q3UX49 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C87499Q3UX49 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C87499Q3UX49 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C87499Q3UX49 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms