Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Skap1Q3UUV5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Skap1Q3UUV5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Skap1Q3UUV5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Skap1Q3UUV5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Skap1Q3UUV5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Skap1Q3UUV5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Skap1Q3UUV5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Skap1Q3UUV5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Skap1Q3UUV5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Skap1Q3UUV5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Skap1Q3UUV5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Skap1Q3UUV5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Skap1Q3UUV5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Skap1Q3UUV5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Skap1Q3UUV5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Skap1Q3UUV5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Skap1Q3UUV5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Skap1Q3UUV5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Skap1Q3UUV5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Skap1Q3UUV5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Skap1Q3UUV5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Skap1Q3UUV5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Skap1Q3UUV5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Skap1Q3UUV5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Skap1Q3UUV5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Skap1Q3UUV5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Skap1Q3UUV5 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Skap1Q3UUV5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Skap1Q3UUV5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Skap1Q3UUV5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Skap1Q3UUV5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Skap1Q3UUV5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Skap1Q3UUV5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Skap1Q3UUV5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Skap1Q3UUV5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Skap1Q3UUV5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Skap1Q3UUV5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Skap1Q3UUV5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Skap1Q3UUV5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Skap1Q3UUV5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Skap1Q3UUV5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Skap1Q3UUV5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Skap1Q3UUV5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Skap1Q3UUV5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Skap1Q3UUV5 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Skap1Q3UUV5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Skap1Q3UUV5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Skap1Q3UUV5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Skap1Q3UUV5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Skap1Q3UUV5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Skap1Q3UUV5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Skap1Q3UUV5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Skap1Q3UUV5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Skap1Q3UUV5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Skap1Q3UUV5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Skap1Q3UUV5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Skap1Q3UUV5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Skap1Q3UUV5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Skap1Q3UUV5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Skap1Q3UUV5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Skap1Q3UUV5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Skap1Q3UUV5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Skap1Q3UUV5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Skap1Q3UUV5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Skap1Q3UUV5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Skap1Q3UUV5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Skap1Q3UUV5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Skap1Q3UUV5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Skap1Q3UUV5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Skap1Q3UUV5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Skap1Q3UUV5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Skap1Q3UUV5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Skap1Q3UUV5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Skap1Q3UUV5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Skap1Q3UUV5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Skap1Q3UUV5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Skap1Q3UUV5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Skap1Q3UUV5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Skap1Q3UUV5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Skap1Q3UUV5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Skap1Q3UUV5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Skap1Q3UUV5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Skap1Q3UUV5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Skap1Q3UUV5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Skap1Q3UUV5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Skap1Q3UUV5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Skap1Q3UUV5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Skap1Q3UUV5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Skap1Q3UUV5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Skap1Q3UUV5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Skap1Q3UUV5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Skap1Q3UUV5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Skap1Q3UUV5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Skap1Q3UUV5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Skap1Q3UUV5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Skap1Q3UUV5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Skap1Q3UUV5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Skap1Q3UUV5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Skap1Q3UUV5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms