Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TceancQ3US16 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TceancQ3US16 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TceancQ3US16 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TceancQ3US16 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TceancQ3US16 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TceancQ3US16 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TceancQ3US16 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TceancQ3US16 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TceancQ3US16 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TceancQ3US16 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TceancQ3US16 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TceancQ3US16 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TceancQ3US16 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TceancQ3US16 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TceancQ3US16 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TceancQ3US16 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TceancQ3US16 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TceancQ3US16 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TceancQ3US16 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TceancQ3US16 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TceancQ3US16 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TceancQ3US16 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TceancQ3US16 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TceancQ3US16 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TceancQ3US16 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TceancQ3US16 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TceancQ3US16 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TceancQ3US16 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TceancQ3US16 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TceancQ3US16 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TceancQ3US16 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TceancQ3US16 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TceancQ3US16 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TceancQ3US16 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TceancQ3US16 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TceancQ3US16 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TceancQ3US16 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TceancQ3US16 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TceancQ3US16 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TceancQ3US16 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TceancQ3US16 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TceancQ3US16 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TceancQ3US16 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TceancQ3US16 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TceancQ3US16 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TceancQ3US16 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TceancQ3US16 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TceancQ3US16 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TceancQ3US16 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TceancQ3US16 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TceancQ3US16 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TceancQ3US16 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TceancQ3US16 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TceancQ3US16 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TceancQ3US16 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TceancQ3US16 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TceancQ3US16 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TceancQ3US16 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TceancQ3US16 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TceancQ3US16 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TceancQ3US16 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TceancQ3US16 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TceancQ3US16 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TceancQ3US16 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TceancQ3US16 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TceancQ3US16 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TceancQ3US16 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TceancQ3US16 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TceancQ3US16 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TceancQ3US16 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TceancQ3US16 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TceancQ3US16 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TceancQ3US16 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TceancQ3US16 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TceancQ3US16 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TceancQ3US16 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TceancQ3US16 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TceancQ3US16 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TceancQ3US16 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TceancQ3US16 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TceancQ3US16 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TceancQ3US16 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TceancQ3US16 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TceancQ3US16 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TceancQ3US16 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TceancQ3US16 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TceancQ3US16 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TceancQ3US16 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TceancQ3US16 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TceancQ3US16 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TceancQ3US16 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TceancQ3US16 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TceancQ3US16 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TceancQ3US16 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TceancQ3US16 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TceancQ3US16 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TceancQ3US16 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TceancQ3US16 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TceancQ3US16 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms