Protein–RNA interactions for Protein: Q3URS2

Zscan4f, Zinc finger and SCAN domain containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4fQ3URS2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zscan4fQ3URS2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Zscan4fQ3URS2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zscan4fQ3URS2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zscan4fQ3URS2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zscan4fQ3URS2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Zscan4fQ3URS2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Zscan4fQ3URS2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zscan4fQ3URS2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zscan4fQ3URS2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Zscan4fQ3URS2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zscan4fQ3URS2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zscan4fQ3URS2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zscan4fQ3URS2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zscan4fQ3URS2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zscan4fQ3URS2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zscan4fQ3URS2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zscan4fQ3URS2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zscan4fQ3URS2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zscan4fQ3URS2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zscan4fQ3URS2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zscan4fQ3URS2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zscan4fQ3URS2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zscan4fQ3URS2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zscan4fQ3URS2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zscan4fQ3URS2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zscan4fQ3URS2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zscan4fQ3URS2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zscan4fQ3URS2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zscan4fQ3URS2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zscan4fQ3URS2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zscan4fQ3URS2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zscan4fQ3URS2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zscan4fQ3URS2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zscan4fQ3URS2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Zscan4fQ3URS2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Zscan4fQ3URS2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Zscan4fQ3URS2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zscan4fQ3URS2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zscan4fQ3URS2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zscan4fQ3URS2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zscan4fQ3URS2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zscan4fQ3URS2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zscan4fQ3URS2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zscan4fQ3URS2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Zscan4fQ3URS2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zscan4fQ3URS2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zscan4fQ3URS2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zscan4fQ3URS2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zscan4fQ3URS2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zscan4fQ3URS2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zscan4fQ3URS2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zscan4fQ3URS2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zscan4fQ3URS2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zscan4fQ3URS2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zscan4fQ3URS2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zscan4fQ3URS2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zscan4fQ3URS2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zscan4fQ3URS2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zscan4fQ3URS2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Zscan4fQ3URS2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zscan4fQ3URS2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Zscan4fQ3URS2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zscan4fQ3URS2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zscan4fQ3URS2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zscan4fQ3URS2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zscan4fQ3URS2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zscan4fQ3URS2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zscan4fQ3URS2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zscan4fQ3URS2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zscan4fQ3URS2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zscan4fQ3URS2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zscan4fQ3URS2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zscan4fQ3URS2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zscan4fQ3URS2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zscan4fQ3URS2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zscan4fQ3URS2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zscan4fQ3URS2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zscan4fQ3URS2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zscan4fQ3URS2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zscan4fQ3URS2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zscan4fQ3URS2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zscan4fQ3URS2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zscan4fQ3URS2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zscan4fQ3URS2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zscan4fQ3URS2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zscan4fQ3URS2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zscan4fQ3URS2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zscan4fQ3URS2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zscan4fQ3URS2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zscan4fQ3URS2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zscan4fQ3URS2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zscan4fQ3URS2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zscan4fQ3URS2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zscan4fQ3URS2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zscan4fQ3URS2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zscan4fQ3URS2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zscan4fQ3URS2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zscan4fQ3URS2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zscan4fQ3URS2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms