Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR50

Vwa5b2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b2Q3UR50 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vwa5b2Q3UR50 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vwa5b2Q3UR50 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vwa5b2Q3UR50 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vwa5b2Q3UR50 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Vwa5b2Q3UR50 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vwa5b2Q3UR50 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vwa5b2Q3UR50 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vwa5b2Q3UR50 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vwa5b2Q3UR50 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Vwa5b2Q3UR50 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vwa5b2Q3UR50 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vwa5b2Q3UR50 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vwa5b2Q3UR50 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vwa5b2Q3UR50 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vwa5b2Q3UR50 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vwa5b2Q3UR50 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vwa5b2Q3UR50 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vwa5b2Q3UR50 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vwa5b2Q3UR50 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vwa5b2Q3UR50 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vwa5b2Q3UR50 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vwa5b2Q3UR50 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vwa5b2Q3UR50 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vwa5b2Q3UR50 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Vwa5b2Q3UR50 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vwa5b2Q3UR50 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Vwa5b2Q3UR50 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vwa5b2Q3UR50 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vwa5b2Q3UR50 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vwa5b2Q3UR50 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vwa5b2Q3UR50 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vwa5b2Q3UR50 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vwa5b2Q3UR50 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Vwa5b2Q3UR50 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vwa5b2Q3UR50 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vwa5b2Q3UR50 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vwa5b2Q3UR50 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vwa5b2Q3UR50 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Vwa5b2Q3UR50 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vwa5b2Q3UR50 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vwa5b2Q3UR50 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vwa5b2Q3UR50 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vwa5b2Q3UR50 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vwa5b2Q3UR50 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vwa5b2Q3UR50 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vwa5b2Q3UR50 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vwa5b2Q3UR50 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vwa5b2Q3UR50 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vwa5b2Q3UR50 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vwa5b2Q3UR50 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vwa5b2Q3UR50 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vwa5b2Q3UR50 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Vwa5b2Q3UR50 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vwa5b2Q3UR50 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vwa5b2Q3UR50 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vwa5b2Q3UR50 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vwa5b2Q3UR50 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vwa5b2Q3UR50 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vwa5b2Q3UR50 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vwa5b2Q3UR50 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vwa5b2Q3UR50 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vwa5b2Q3UR50 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vwa5b2Q3UR50 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vwa5b2Q3UR50 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vwa5b2Q3UR50 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vwa5b2Q3UR50 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vwa5b2Q3UR50 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vwa5b2Q3UR50 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vwa5b2Q3UR50 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Vwa5b2Q3UR50 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vwa5b2Q3UR50 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vwa5b2Q3UR50 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vwa5b2Q3UR50 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vwa5b2Q3UR50 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vwa5b2Q3UR50 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vwa5b2Q3UR50 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vwa5b2Q3UR50 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vwa5b2Q3UR50 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vwa5b2Q3UR50 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vwa5b2Q3UR50 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vwa5b2Q3UR50 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vwa5b2Q3UR50 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vwa5b2Q3UR50 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vwa5b2Q3UR50 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vwa5b2Q3UR50 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vwa5b2Q3UR50 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vwa5b2Q3UR50 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Vwa5b2Q3UR50 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vwa5b2Q3UR50 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vwa5b2Q3UR50 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vwa5b2Q3UR50 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vwa5b2Q3UR50 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vwa5b2Q3UR50 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vwa5b2Q3UR50 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vwa5b2Q3UR50 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vwa5b2Q3UR50 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Vwa5b2Q3UR50 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vwa5b2Q3UR50 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vwa5b2Q3UR50 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms