Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem253Q3UNB8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem253Q3UNB8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem253Q3UNB8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem253Q3UNB8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem253Q3UNB8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem253Q3UNB8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem253Q3UNB8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem253Q3UNB8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem253Q3UNB8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem253Q3UNB8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem253Q3UNB8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem253Q3UNB8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem253Q3UNB8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmem253Q3UNB8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmem253Q3UNB8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmem253Q3UNB8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmem253Q3UNB8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmem253Q3UNB8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmem253Q3UNB8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmem253Q3UNB8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmem253Q3UNB8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmem253Q3UNB8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmem253Q3UNB8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem253Q3UNB8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem253Q3UNB8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem253Q3UNB8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem253Q3UNB8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem253Q3UNB8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem253Q3UNB8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem253Q3UNB8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem253Q3UNB8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem253Q3UNB8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem253Q3UNB8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem253Q3UNB8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem253Q3UNB8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem253Q3UNB8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem253Q3UNB8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem253Q3UNB8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem253Q3UNB8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem253Q3UNB8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem253Q3UNB8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem253Q3UNB8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem253Q3UNB8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem253Q3UNB8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem253Q3UNB8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem253Q3UNB8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem253Q3UNB8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem253Q3UNB8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem253Q3UNB8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem253Q3UNB8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem253Q3UNB8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem253Q3UNB8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem253Q3UNB8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem253Q3UNB8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem253Q3UNB8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem253Q3UNB8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem253Q3UNB8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem253Q3UNB8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem253Q3UNB8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem253Q3UNB8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem253Q3UNB8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem253Q3UNB8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem253Q3UNB8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem253Q3UNB8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem253Q3UNB8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem253Q3UNB8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem253Q3UNB8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem253Q3UNB8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem253Q3UNB8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem253Q3UNB8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem253Q3UNB8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem253Q3UNB8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem253Q3UNB8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem253Q3UNB8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem253Q3UNB8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem253Q3UNB8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem253Q3UNB8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem253Q3UNB8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem253Q3UNB8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem253Q3UNB8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem253Q3UNB8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem253Q3UNB8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem253Q3UNB8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem253Q3UNB8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem253Q3UNB8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem253Q3UNB8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem253Q3UNB8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem253Q3UNB8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem253Q3UNB8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem253Q3UNB8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem253Q3UNB8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem253Q3UNB8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem253Q3UNB8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem253Q3UNB8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem253Q3UNB8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem253Q3UNB8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem253Q3UNB8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem253Q3UNB8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem253Q3UNB8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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