Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp30Q3UN04 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp30Q3UN04 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp30Q3UN04 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp30Q3UN04 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp30Q3UN04 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp30Q3UN04 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp30Q3UN04 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp30Q3UN04 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp30Q3UN04 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp30Q3UN04 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp30Q3UN04 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp30Q3UN04 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp30Q3UN04 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp30Q3UN04 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp30Q3UN04 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp30Q3UN04 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp30Q3UN04 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp30Q3UN04 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp30Q3UN04 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp30Q3UN04 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp30Q3UN04 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp30Q3UN04 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp30Q3UN04 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp30Q3UN04 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp30Q3UN04 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp30Q3UN04 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp30Q3UN04 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp30Q3UN04 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp30Q3UN04 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp30Q3UN04 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp30Q3UN04 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp30Q3UN04 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Usp30Q3UN04 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp30Q3UN04 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp30Q3UN04 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp30Q3UN04 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp30Q3UN04 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp30Q3UN04 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp30Q3UN04 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp30Q3UN04 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp30Q3UN04 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp30Q3UN04 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp30Q3UN04 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp30Q3UN04 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp30Q3UN04 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp30Q3UN04 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp30Q3UN04 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp30Q3UN04 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp30Q3UN04 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp30Q3UN04 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp30Q3UN04 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp30Q3UN04 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp30Q3UN04 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp30Q3UN04 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp30Q3UN04 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp30Q3UN04 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp30Q3UN04 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp30Q3UN04 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp30Q3UN04 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp30Q3UN04 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp30Q3UN04 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp30Q3UN04 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp30Q3UN04 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp30Q3UN04 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp30Q3UN04 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp30Q3UN04 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp30Q3UN04 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp30Q3UN04 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp30Q3UN04 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp30Q3UN04 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp30Q3UN04 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp30Q3UN04 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp30Q3UN04 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp30Q3UN04 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp30Q3UN04 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp30Q3UN04 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp30Q3UN04 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp30Q3UN04 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp30Q3UN04 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp30Q3UN04 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp30Q3UN04 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp30Q3UN04 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp30Q3UN04 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp30Q3UN04 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp30Q3UN04 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp30Q3UN04 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp30Q3UN04 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp30Q3UN04 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp30Q3UN04 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp30Q3UN04 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp30Q3UN04 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp30Q3UN04 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp30Q3UN04 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp30Q3UN04 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp30Q3UN04 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp30Q3UN04 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp30Q3UN04 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp30Q3UN04 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp30Q3UN04 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms