Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdgfl2Q3UMU9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hdgfl2Q3UMU9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdgfl2Q3UMU9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdgfl2Q3UMU9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdgfl2Q3UMU9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdgfl2Q3UMU9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdgfl2Q3UMU9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdgfl2Q3UMU9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdgfl2Q3UMU9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdgfl2Q3UMU9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdgfl2Q3UMU9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdgfl2Q3UMU9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdgfl2Q3UMU9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdgfl2Q3UMU9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdgfl2Q3UMU9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdgfl2Q3UMU9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdgfl2Q3UMU9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdgfl2Q3UMU9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdgfl2Q3UMU9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdgfl2Q3UMU9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdgfl2Q3UMU9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdgfl2Q3UMU9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdgfl2Q3UMU9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdgfl2Q3UMU9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdgfl2Q3UMU9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdgfl2Q3UMU9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdgfl2Q3UMU9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdgfl2Q3UMU9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdgfl2Q3UMU9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdgfl2Q3UMU9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdgfl2Q3UMU9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdgfl2Q3UMU9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdgfl2Q3UMU9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdgfl2Q3UMU9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdgfl2Q3UMU9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdgfl2Q3UMU9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdgfl2Q3UMU9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdgfl2Q3UMU9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdgfl2Q3UMU9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdgfl2Q3UMU9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdgfl2Q3UMU9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdgfl2Q3UMU9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdgfl2Q3UMU9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdgfl2Q3UMU9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdgfl2Q3UMU9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdgfl2Q3UMU9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdgfl2Q3UMU9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdgfl2Q3UMU9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdgfl2Q3UMU9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdgfl2Q3UMU9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdgfl2Q3UMU9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdgfl2Q3UMU9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdgfl2Q3UMU9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdgfl2Q3UMU9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdgfl2Q3UMU9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdgfl2Q3UMU9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdgfl2Q3UMU9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdgfl2Q3UMU9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdgfl2Q3UMU9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdgfl2Q3UMU9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdgfl2Q3UMU9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdgfl2Q3UMU9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdgfl2Q3UMU9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdgfl2Q3UMU9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdgfl2Q3UMU9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms