Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM45

Ppp1r7, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r7Q3UM45 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp1r7Q3UM45 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp1r7Q3UM45 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp1r7Q3UM45 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp1r7Q3UM45 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp1r7Q3UM45 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp1r7Q3UM45 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp1r7Q3UM45 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp1r7Q3UM45 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp1r7Q3UM45 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp1r7Q3UM45 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp1r7Q3UM45 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp1r7Q3UM45 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp1r7Q3UM45 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp1r7Q3UM45 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp1r7Q3UM45 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp1r7Q3UM45 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp1r7Q3UM45 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp1r7Q3UM45 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp1r7Q3UM45 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp1r7Q3UM45 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp1r7Q3UM45 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp1r7Q3UM45 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp1r7Q3UM45 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp1r7Q3UM45 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp1r7Q3UM45 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp1r7Q3UM45 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp1r7Q3UM45 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp1r7Q3UM45 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp1r7Q3UM45 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp1r7Q3UM45 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp1r7Q3UM45 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp1r7Q3UM45 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp1r7Q3UM45 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp1r7Q3UM45 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp1r7Q3UM45 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp1r7Q3UM45 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp1r7Q3UM45 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp1r7Q3UM45 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp1r7Q3UM45 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp1r7Q3UM45 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp1r7Q3UM45 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp1r7Q3UM45 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp1r7Q3UM45 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ppp1r7Q3UM45 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ppp1r7Q3UM45 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ppp1r7Q3UM45 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp1r7Q3UM45 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp1r7Q3UM45 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp1r7Q3UM45 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp1r7Q3UM45 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp1r7Q3UM45 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp1r7Q3UM45 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp1r7Q3UM45 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1r7Q3UM45 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1r7Q3UM45 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1r7Q3UM45 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1r7Q3UM45 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1r7Q3UM45 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1r7Q3UM45 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1r7Q3UM45 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1r7Q3UM45 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r7Q3UM45 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r7Q3UM45 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r7Q3UM45 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r7Q3UM45 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r7Q3UM45 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1r7Q3UM45 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1r7Q3UM45 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1r7Q3UM45 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1r7Q3UM45 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1r7Q3UM45 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r7Q3UM45 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r7Q3UM45 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r7Q3UM45 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r7Q3UM45 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r7Q3UM45 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1r7Q3UM45 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1r7Q3UM45 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1r7Q3UM45 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1r7Q3UM45 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1r7Q3UM45 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1r7Q3UM45 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r7Q3UM45 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r7Q3UM45 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r7Q3UM45 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r7Q3UM45 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r7Q3UM45 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r7Q3UM45 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r7Q3UM45 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp1r7Q3UM45 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp1r7Q3UM45 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp1r7Q3UM45 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp1r7Q3UM45 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp1r7Q3UM45 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp1r7Q3UM45 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp1r7Q3UM45 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp1r7Q3UM45 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp1r7Q3UM45 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp1r7Q3UM45 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.2 ms