Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULL6

Upf3b, UPF3 regulator of nonsense transcripts homolog B (yeast), mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf3bQ3ULL6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Upf3bQ3ULL6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Upf3bQ3ULL6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Upf3bQ3ULL6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Upf3bQ3ULL6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Upf3bQ3ULL6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Upf3bQ3ULL6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Upf3bQ3ULL6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Upf3bQ3ULL6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Upf3bQ3ULL6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Upf3bQ3ULL6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Upf3bQ3ULL6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Upf3bQ3ULL6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Upf3bQ3ULL6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Upf3bQ3ULL6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Upf3bQ3ULL6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Upf3bQ3ULL6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Upf3bQ3ULL6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Upf3bQ3ULL6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Upf3bQ3ULL6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Upf3bQ3ULL6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Upf3bQ3ULL6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Upf3bQ3ULL6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Upf3bQ3ULL6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Upf3bQ3ULL6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Upf3bQ3ULL6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Upf3bQ3ULL6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Upf3bQ3ULL6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Upf3bQ3ULL6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Upf3bQ3ULL6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Upf3bQ3ULL6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Upf3bQ3ULL6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Upf3bQ3ULL6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Upf3bQ3ULL6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Upf3bQ3ULL6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Upf3bQ3ULL6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Upf3bQ3ULL6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Upf3bQ3ULL6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Upf3bQ3ULL6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Upf3bQ3ULL6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Upf3bQ3ULL6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Upf3bQ3ULL6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Upf3bQ3ULL6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Upf3bQ3ULL6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Upf3bQ3ULL6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Upf3bQ3ULL6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Upf3bQ3ULL6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Upf3bQ3ULL6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Upf3bQ3ULL6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Upf3bQ3ULL6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Upf3bQ3ULL6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Upf3bQ3ULL6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Upf3bQ3ULL6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Upf3bQ3ULL6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Upf3bQ3ULL6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Upf3bQ3ULL6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Upf3bQ3ULL6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Upf3bQ3ULL6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Upf3bQ3ULL6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Upf3bQ3ULL6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Upf3bQ3ULL6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Upf3bQ3ULL6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Upf3bQ3ULL6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Upf3bQ3ULL6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Upf3bQ3ULL6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Upf3bQ3ULL6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Upf3bQ3ULL6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Upf3bQ3ULL6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Upf3bQ3ULL6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Upf3bQ3ULL6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Upf3bQ3ULL6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Upf3bQ3ULL6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Upf3bQ3ULL6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Upf3bQ3ULL6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Upf3bQ3ULL6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Upf3bQ3ULL6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Upf3bQ3ULL6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Upf3bQ3ULL6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Upf3bQ3ULL6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Upf3bQ3ULL6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Upf3bQ3ULL6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Upf3bQ3ULL6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Upf3bQ3ULL6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Upf3bQ3ULL6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Upf3bQ3ULL6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Upf3bQ3ULL6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Upf3bQ3ULL6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Upf3bQ3ULL6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Upf3bQ3ULL6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Upf3bQ3ULL6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Upf3bQ3ULL6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Upf3bQ3ULL6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Upf3bQ3ULL6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Upf3bQ3ULL6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Upf3bQ3ULL6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Upf3bQ3ULL6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Upf3bQ3ULL6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Upf3bQ3ULL6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Upf3bQ3ULL6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Upf3bQ3ULL6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.7 ms