Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ell2Q3UKU1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ell2Q3UKU1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ell2Q3UKU1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ell2Q3UKU1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ell2Q3UKU1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ell2Q3UKU1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ell2Q3UKU1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ell2Q3UKU1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ell2Q3UKU1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ell2Q3UKU1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ell2Q3UKU1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ell2Q3UKU1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ell2Q3UKU1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ell2Q3UKU1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ell2Q3UKU1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ell2Q3UKU1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Ell2Q3UKU1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Ell2Q3UKU1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ell2Q3UKU1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ell2Q3UKU1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ell2Q3UKU1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ell2Q3UKU1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ell2Q3UKU1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ell2Q3UKU1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ell2Q3UKU1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ell2Q3UKU1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ell2Q3UKU1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ell2Q3UKU1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ell2Q3UKU1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ell2Q3UKU1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ell2Q3UKU1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ell2Q3UKU1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Ell2Q3UKU1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ell2Q3UKU1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ell2Q3UKU1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ell2Q3UKU1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ell2Q3UKU1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ell2Q3UKU1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ell2Q3UKU1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ell2Q3UKU1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ell2Q3UKU1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ell2Q3UKU1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ell2Q3UKU1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ell2Q3UKU1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ell2Q3UKU1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ell2Q3UKU1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ell2Q3UKU1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ell2Q3UKU1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ell2Q3UKU1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ell2Q3UKU1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ell2Q3UKU1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ell2Q3UKU1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ell2Q3UKU1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ell2Q3UKU1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ell2Q3UKU1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ell2Q3UKU1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ell2Q3UKU1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ell2Q3UKU1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ell2Q3UKU1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ell2Q3UKU1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ell2Q3UKU1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ell2Q3UKU1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ell2Q3UKU1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ell2Q3UKU1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ell2Q3UKU1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ell2Q3UKU1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ell2Q3UKU1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ell2Q3UKU1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ell2Q3UKU1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ell2Q3UKU1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ell2Q3UKU1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ell2Q3UKU1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ell2Q3UKU1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ell2Q3UKU1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ell2Q3UKU1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ell2Q3UKU1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ell2Q3UKU1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ell2Q3UKU1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ell2Q3UKU1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ell2Q3UKU1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ell2Q3UKU1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ell2Q3UKU1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ell2Q3UKU1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ell2Q3UKU1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ell2Q3UKU1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ell2Q3UKU1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ell2Q3UKU1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ell2Q3UKU1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ell2Q3UKU1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ell2Q3UKU1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ell2Q3UKU1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ell2Q3UKU1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ell2Q3UKU1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ell2Q3UKU1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ell2Q3UKU1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ell2Q3UKU1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ell2Q3UKU1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ell2Q3UKU1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ell2Q3UKU1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms