Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smu1Q3UKJ7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Smu1Q3UKJ7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms