Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Usp19Q3UJD6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Usp19Q3UJD6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Usp19Q3UJD6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Usp19Q3UJD6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Usp19Q3UJD6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Usp19Q3UJD6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Usp19Q3UJD6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Usp19Q3UJD6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Usp19Q3UJD6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Usp19Q3UJD6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Usp19Q3UJD6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Usp19Q3UJD6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Usp19Q3UJD6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Usp19Q3UJD6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Usp19Q3UJD6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Usp19Q3UJD6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Usp19Q3UJD6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Usp19Q3UJD6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Usp19Q3UJD6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Usp19Q3UJD6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Usp19Q3UJD6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Usp19Q3UJD6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Usp19Q3UJD6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Usp19Q3UJD6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Usp19Q3UJD6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Usp19Q3UJD6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Usp19Q3UJD6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Usp19Q3UJD6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Usp19Q3UJD6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Usp19Q3UJD6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Usp19Q3UJD6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Usp19Q3UJD6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Usp19Q3UJD6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Usp19Q3UJD6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Usp19Q3UJD6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Usp19Q3UJD6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Usp19Q3UJD6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Usp19Q3UJD6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Usp19Q3UJD6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Usp19Q3UJD6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Usp19Q3UJD6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Usp19Q3UJD6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Usp19Q3UJD6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Usp19Q3UJD6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Usp19Q3UJD6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Usp19Q3UJD6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Usp19Q3UJD6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Usp19Q3UJD6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Usp19Q3UJD6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Usp19Q3UJD6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Usp19Q3UJD6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Usp19Q3UJD6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Usp19Q3UJD6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Usp19Q3UJD6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Usp19Q3UJD6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Usp19Q3UJD6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Usp19Q3UJD6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Usp19Q3UJD6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Usp19Q3UJD6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Usp19Q3UJD6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Usp19Q3UJD6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Usp19Q3UJD6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Usp19Q3UJD6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Usp19Q3UJD6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Usp19Q3UJD6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Usp19Q3UJD6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Usp19Q3UJD6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Usp19Q3UJD6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Usp19Q3UJD6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Usp19Q3UJD6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Usp19Q3UJD6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Usp19Q3UJD6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Usp19Q3UJD6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Usp19Q3UJD6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Usp19Q3UJD6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Usp19Q3UJD6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Usp19Q3UJD6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Usp19Q3UJD6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Usp19Q3UJD6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Usp19Q3UJD6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Usp19Q3UJD6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Usp19Q3UJD6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Usp19Q3UJD6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Usp19Q3UJD6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Usp19Q3UJD6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Usp19Q3UJD6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Usp19Q3UJD6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Usp19Q3UJD6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Usp19Q3UJD6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Usp19Q3UJD6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Usp19Q3UJD6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Usp19Q3UJD6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Usp19Q3UJD6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Usp19Q3UJD6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Usp19Q3UJD6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Usp19Q3UJD6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Usp19Q3UJD6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Usp19Q3UJD6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Usp19Q3UJD6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms