Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI4

Tmed8, Protein TMED8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed8Q3UHI4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tmed8Q3UHI4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tmed8Q3UHI4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tmed8Q3UHI4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tmed8Q3UHI4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Tmed8Q3UHI4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tmed8Q3UHI4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tmed8Q3UHI4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tmed8Q3UHI4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tmed8Q3UHI4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tmed8Q3UHI4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tmed8Q3UHI4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Tmed8Q3UHI4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tmed8Q3UHI4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tmed8Q3UHI4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tmed8Q3UHI4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tmed8Q3UHI4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tmed8Q3UHI4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tmed8Q3UHI4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tmed8Q3UHI4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tmed8Q3UHI4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tmed8Q3UHI4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Tmed8Q3UHI4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tmed8Q3UHI4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tmed8Q3UHI4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tmed8Q3UHI4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tmed8Q3UHI4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tmed8Q3UHI4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tmed8Q3UHI4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tmed8Q3UHI4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tmed8Q3UHI4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tmed8Q3UHI4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tmed8Q3UHI4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tmed8Q3UHI4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tmed8Q3UHI4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tmed8Q3UHI4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tmed8Q3UHI4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tmed8Q3UHI4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tmed8Q3UHI4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Tmed8Q3UHI4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tmed8Q3UHI4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tmed8Q3UHI4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tmed8Q3UHI4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tmed8Q3UHI4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tmed8Q3UHI4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tmed8Q3UHI4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tmed8Q3UHI4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmed8Q3UHI4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmed8Q3UHI4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmed8Q3UHI4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tmed8Q3UHI4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tmed8Q3UHI4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tmed8Q3UHI4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tmed8Q3UHI4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tmed8Q3UHI4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmed8Q3UHI4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmed8Q3UHI4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmed8Q3UHI4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmed8Q3UHI4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tmed8Q3UHI4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tmed8Q3UHI4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmed8Q3UHI4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmed8Q3UHI4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmed8Q3UHI4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmed8Q3UHI4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmed8Q3UHI4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmed8Q3UHI4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmed8Q3UHI4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmed8Q3UHI4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmed8Q3UHI4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tmed8Q3UHI4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tmed8Q3UHI4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tmed8Q3UHI4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tmed8Q3UHI4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tmed8Q3UHI4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tmed8Q3UHI4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tmed8Q3UHI4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmed8Q3UHI4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmed8Q3UHI4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tmed8Q3UHI4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tmed8Q3UHI4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tmed8Q3UHI4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tmed8Q3UHI4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmed8Q3UHI4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmed8Q3UHI4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmed8Q3UHI4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmed8Q3UHI4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmed8Q3UHI4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmed8Q3UHI4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmed8Q3UHI4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmed8Q3UHI4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmed8Q3UHI4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmed8Q3UHI4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmed8Q3UHI4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmed8Q3UHI4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tmed8Q3UHI4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tmed8Q3UHI4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tmed8Q3UHI4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tmed8Q3UHI4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tmed8Q3UHI4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms