Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pitpnm3Q3UHE1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pitpnm3Q3UHE1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pitpnm3Q3UHE1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pitpnm3Q3UHE1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pitpnm3Q3UHE1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pitpnm3Q3UHE1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pitpnm3Q3UHE1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pitpnm3Q3UHE1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pitpnm3Q3UHE1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pitpnm3Q3UHE1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pitpnm3Q3UHE1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pitpnm3Q3UHE1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pitpnm3Q3UHE1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pitpnm3Q3UHE1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pitpnm3Q3UHE1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pitpnm3Q3UHE1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pitpnm3Q3UHE1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pitpnm3Q3UHE1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pitpnm3Q3UHE1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pitpnm3Q3UHE1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pitpnm3Q3UHE1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pitpnm3Q3UHE1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pitpnm3Q3UHE1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pitpnm3Q3UHE1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pitpnm3Q3UHE1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pitpnm3Q3UHE1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pitpnm3Q3UHE1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pitpnm3Q3UHE1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pitpnm3Q3UHE1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pitpnm3Q3UHE1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pitpnm3Q3UHE1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pitpnm3Q3UHE1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pitpnm3Q3UHE1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pitpnm3Q3UHE1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pitpnm3Q3UHE1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pitpnm3Q3UHE1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pitpnm3Q3UHE1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pitpnm3Q3UHE1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pitpnm3Q3UHE1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pitpnm3Q3UHE1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pitpnm3Q3UHE1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pitpnm3Q3UHE1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pitpnm3Q3UHE1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pitpnm3Q3UHE1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pitpnm3Q3UHE1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pitpnm3Q3UHE1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pitpnm3Q3UHE1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pitpnm3Q3UHE1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pitpnm3Q3UHE1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pitpnm3Q3UHE1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pitpnm3Q3UHE1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pitpnm3Q3UHE1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pitpnm3Q3UHE1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pitpnm3Q3UHE1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pitpnm3Q3UHE1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pitpnm3Q3UHE1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pitpnm3Q3UHE1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pitpnm3Q3UHE1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pitpnm3Q3UHE1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pitpnm3Q3UHE1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pitpnm3Q3UHE1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pitpnm3Q3UHE1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pitpnm3Q3UHE1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pitpnm3Q3UHE1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pitpnm3Q3UHE1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pitpnm3Q3UHE1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pitpnm3Q3UHE1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pitpnm3Q3UHE1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pitpnm3Q3UHE1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pitpnm3Q3UHE1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pitpnm3Q3UHE1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pitpnm3Q3UHE1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pitpnm3Q3UHE1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pitpnm3Q3UHE1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pitpnm3Q3UHE1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pitpnm3Q3UHE1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pitpnm3Q3UHE1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pitpnm3Q3UHE1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pitpnm3Q3UHE1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pitpnm3Q3UHE1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pitpnm3Q3UHE1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pitpnm3Q3UHE1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pitpnm3Q3UHE1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pitpnm3Q3UHE1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pitpnm3Q3UHE1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pitpnm3Q3UHE1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pitpnm3Q3UHE1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pitpnm3Q3UHE1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pitpnm3Q3UHE1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pitpnm3Q3UHE1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pitpnm3Q3UHE1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pitpnm3Q3UHE1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pitpnm3Q3UHE1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pitpnm3Q3UHE1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pitpnm3Q3UHE1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pitpnm3Q3UHE1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms