Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Yipf3Q3UDR8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Yipf3Q3UDR8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Yipf3Q3UDR8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Yipf3Q3UDR8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Yipf3Q3UDR8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Yipf3Q3UDR8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Yipf3Q3UDR8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Yipf3Q3UDR8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Yipf3Q3UDR8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Yipf3Q3UDR8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Yipf3Q3UDR8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Yipf3Q3UDR8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Yipf3Q3UDR8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Yipf3Q3UDR8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Yipf3Q3UDR8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Yipf3Q3UDR8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Yipf3Q3UDR8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Yipf3Q3UDR8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Yipf3Q3UDR8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Yipf3Q3UDR8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Yipf3Q3UDR8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Yipf3Q3UDR8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Yipf3Q3UDR8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Yipf3Q3UDR8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Yipf3Q3UDR8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Yipf3Q3UDR8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Yipf3Q3UDR8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Yipf3Q3UDR8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Yipf3Q3UDR8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Yipf3Q3UDR8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Yipf3Q3UDR8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Yipf3Q3UDR8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Yipf3Q3UDR8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Yipf3Q3UDR8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Yipf3Q3UDR8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Yipf3Q3UDR8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Yipf3Q3UDR8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Yipf3Q3UDR8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Yipf3Q3UDR8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Yipf3Q3UDR8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Yipf3Q3UDR8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Yipf3Q3UDR8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Yipf3Q3UDR8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Yipf3Q3UDR8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Yipf3Q3UDR8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Yipf3Q3UDR8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Yipf3Q3UDR8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Yipf3Q3UDR8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Yipf3Q3UDR8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Yipf3Q3UDR8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Yipf3Q3UDR8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Yipf3Q3UDR8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Yipf3Q3UDR8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Yipf3Q3UDR8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Yipf3Q3UDR8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Yipf3Q3UDR8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Yipf3Q3UDR8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Yipf3Q3UDR8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Yipf3Q3UDR8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Yipf3Q3UDR8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Yipf3Q3UDR8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Yipf3Q3UDR8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Yipf3Q3UDR8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Yipf3Q3UDR8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Yipf3Q3UDR8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Yipf3Q3UDR8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Yipf3Q3UDR8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Yipf3Q3UDR8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Yipf3Q3UDR8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Yipf3Q3UDR8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Yipf3Q3UDR8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Yipf3Q3UDR8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Yipf3Q3UDR8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Yipf3Q3UDR8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Yipf3Q3UDR8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Yipf3Q3UDR8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Yipf3Q3UDR8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Yipf3Q3UDR8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Yipf3Q3UDR8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Yipf3Q3UDR8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Yipf3Q3UDR8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Yipf3Q3UDR8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Yipf3Q3UDR8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Yipf3Q3UDR8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Yipf3Q3UDR8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Yipf3Q3UDR8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Yipf3Q3UDR8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Yipf3Q3UDR8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Yipf3Q3UDR8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Yipf3Q3UDR8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Yipf3Q3UDR8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Yipf3Q3UDR8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Yipf3Q3UDR8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Yipf3Q3UDR8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Yipf3Q3UDR8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Yipf3Q3UDR8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Yipf3Q3UDR8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Yipf3Q3UDR8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Yipf3Q3UDR8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms