Protein–RNA interactions for Protein: Q3U7U4

Transmembrane protein C1orf162 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U7U4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3U7U4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q3U7U4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3U7U4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3U7U4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3U7U4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3U7U4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3U7U4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3U7U4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3U7U4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3U7U4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3U7U4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3U7U4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3U7U4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3U7U4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3U7U4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3U7U4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3U7U4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3U7U4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3U7U4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3U7U4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3U7U4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3U7U4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3U7U4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3U7U4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3U7U4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3U7U4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Q3U7U4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q3U7U4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3U7U4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3U7U4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q3U7U4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3U7U4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3U7U4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3U7U4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3U7U4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q3U7U4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3U7U4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q3U7U4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3U7U4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3U7U4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3U7U4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3U7U4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3U7U4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3U7U4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q3U7U4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3U7U4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q3U7U4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Q3U7U4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Q3U7U4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Q3U7U4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q3U7U4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3U7U4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3U7U4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3U7U4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Q3U7U4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Q3U7U4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3U7U4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q3U7U4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3U7U4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3U7U4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q3U7U4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3U7U4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q3U7U4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3U7U4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Q3U7U4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Q3U7U4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q3U7U4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3U7U4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Q3U7U4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3U7U4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3U7U4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3U7U4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q3U7U4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3U7U4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3U7U4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3U7U4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3U7U4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3U7U4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3U7U4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3U7U4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3U7U4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3U7U4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3U7U4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3U7U4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3U7U4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3U7U4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3U7U4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3U7U4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3U7U4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3U7U4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3U7U4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3U7U4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3U7U4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3U7U4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3U7U4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3U7U4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3U7U4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3U7U4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3U7U4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms