Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q3U595 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q3U595 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q3U595 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q3U595 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q3U595 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q3U595 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q3U595 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q3U595 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q3U595 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q3U595 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q3U595 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q3U595 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q3U595 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q3U595 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q3U595 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q3U595 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Q3U595 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Q3U595 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q3U595 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q3U595 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q3U595 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q3U595 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q3U595 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q3U595 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q3U595 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q3U595 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q3U595 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q3U595 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q3U595 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q3U595 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q3U595 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q3U595 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q3U595 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q3U595 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q3U595 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q3U595 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q3U595 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q3U595 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q3U595 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3U595 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3U595 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3U595 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3U595 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3U595 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3U595 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3U595 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3U595 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3U595 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q3U595 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q3U595 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q3U595 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q3U595 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q3U595 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q3U595 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q3U595 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q3U595 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q3U595 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3U595 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3U595 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3U595 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3U595 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3U595 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3U595 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3U595 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3U595 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3U595 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3U595 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3U595 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3U595 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3U595 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3U595 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3U595 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3U595 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3U595 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3U595 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3U595 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3U595 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3U595 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3U595 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3U595 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3U595 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3U595 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3U595 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3U595 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3U595 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3U595 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3U595 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3U595 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3U595 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3U595 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3U595 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3U595 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3U595 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3U595 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3U595 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3U595 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3U595 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3U595 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3U595 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms