Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0L2

Ankrd33b, Ankyrin repeat domain-containing protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd33bQ3U0L2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ankrd33bQ3U0L2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ankrd33bQ3U0L2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ankrd33bQ3U0L2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ankrd33bQ3U0L2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ankrd33bQ3U0L2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ankrd33bQ3U0L2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ankrd33bQ3U0L2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ankrd33bQ3U0L2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ankrd33bQ3U0L2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ankrd33bQ3U0L2 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ankrd33bQ3U0L2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ankrd33bQ3U0L2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ankrd33bQ3U0L2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ankrd33bQ3U0L2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ankrd33bQ3U0L2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ankrd33bQ3U0L2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ankrd33bQ3U0L2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ankrd33bQ3U0L2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ankrd33bQ3U0L2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ankrd33bQ3U0L2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ankrd33bQ3U0L2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ankrd33bQ3U0L2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ankrd33bQ3U0L2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ankrd33bQ3U0L2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ankrd33bQ3U0L2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ankrd33bQ3U0L2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ankrd33bQ3U0L2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ankrd33bQ3U0L2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ankrd33bQ3U0L2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ankrd33bQ3U0L2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ankrd33bQ3U0L2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ankrd33bQ3U0L2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ankrd33bQ3U0L2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ankrd33bQ3U0L2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ankrd33bQ3U0L2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ankrd33bQ3U0L2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ankrd33bQ3U0L2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ankrd33bQ3U0L2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ankrd33bQ3U0L2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ankrd33bQ3U0L2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ankrd33bQ3U0L2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ankrd33bQ3U0L2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ankrd33bQ3U0L2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ankrd33bQ3U0L2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ankrd33bQ3U0L2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ankrd33bQ3U0L2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ankrd33bQ3U0L2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ankrd33bQ3U0L2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ankrd33bQ3U0L2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ankrd33bQ3U0L2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ankrd33bQ3U0L2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ankrd33bQ3U0L2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ankrd33bQ3U0L2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ankrd33bQ3U0L2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ankrd33bQ3U0L2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ankrd33bQ3U0L2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ankrd33bQ3U0L2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ankrd33bQ3U0L2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ankrd33bQ3U0L2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ankrd33bQ3U0L2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ankrd33bQ3U0L2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ankrd33bQ3U0L2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ankrd33bQ3U0L2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ankrd33bQ3U0L2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ankrd33bQ3U0L2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ankrd33bQ3U0L2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ankrd33bQ3U0L2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ankrd33bQ3U0L2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ankrd33bQ3U0L2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ankrd33bQ3U0L2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ankrd33bQ3U0L2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ankrd33bQ3U0L2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ankrd33bQ3U0L2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ankrd33bQ3U0L2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ankrd33bQ3U0L2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ankrd33bQ3U0L2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ankrd33bQ3U0L2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ankrd33bQ3U0L2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ankrd33bQ3U0L2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ankrd33bQ3U0L2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ankrd33bQ3U0L2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ankrd33bQ3U0L2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ankrd33bQ3U0L2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ankrd33bQ3U0L2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ankrd33bQ3U0L2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ankrd33bQ3U0L2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ankrd33bQ3U0L2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ankrd33bQ3U0L2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ankrd33bQ3U0L2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ankrd33bQ3U0L2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ankrd33bQ3U0L2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ankrd33bQ3U0L2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ankrd33bQ3U0L2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ankrd33bQ3U0L2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ankrd33bQ3U0L2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ankrd33bQ3U0L2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ankrd33bQ3U0L2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ankrd33bQ3U0L2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ankrd33bQ3U0L2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms