Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tbc1d2bQ3U0J8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tbc1d2bQ3U0J8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tbc1d2bQ3U0J8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tbc1d2bQ3U0J8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tbc1d2bQ3U0J8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tbc1d2bQ3U0J8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tbc1d2bQ3U0J8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tbc1d2bQ3U0J8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tbc1d2bQ3U0J8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tbc1d2bQ3U0J8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Tbc1d2bQ3U0J8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tbc1d2bQ3U0J8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tbc1d2bQ3U0J8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tbc1d2bQ3U0J8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tbc1d2bQ3U0J8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tbc1d2bQ3U0J8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tbc1d2bQ3U0J8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tbc1d2bQ3U0J8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tbc1d2bQ3U0J8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tbc1d2bQ3U0J8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tbc1d2bQ3U0J8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tbc1d2bQ3U0J8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tbc1d2bQ3U0J8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tbc1d2bQ3U0J8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tbc1d2bQ3U0J8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tbc1d2bQ3U0J8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tbc1d2bQ3U0J8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Tbc1d2bQ3U0J8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tbc1d2bQ3U0J8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tbc1d2bQ3U0J8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tbc1d2bQ3U0J8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tbc1d2bQ3U0J8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tbc1d2bQ3U0J8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tbc1d2bQ3U0J8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Tbc1d2bQ3U0J8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Tbc1d2bQ3U0J8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tbc1d2bQ3U0J8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tbc1d2bQ3U0J8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tbc1d2bQ3U0J8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tbc1d2bQ3U0J8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Tbc1d2bQ3U0J8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tbc1d2bQ3U0J8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tbc1d2bQ3U0J8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tbc1d2bQ3U0J8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tbc1d2bQ3U0J8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tbc1d2bQ3U0J8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tbc1d2bQ3U0J8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tbc1d2bQ3U0J8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tbc1d2bQ3U0J8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tbc1d2bQ3U0J8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tbc1d2bQ3U0J8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tbc1d2bQ3U0J8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tbc1d2bQ3U0J8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tbc1d2bQ3U0J8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tbc1d2bQ3U0J8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tbc1d2bQ3U0J8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tbc1d2bQ3U0J8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tbc1d2bQ3U0J8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tbc1d2bQ3U0J8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tbc1d2bQ3U0J8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tbc1d2bQ3U0J8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tbc1d2bQ3U0J8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tbc1d2bQ3U0J8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tbc1d2bQ3U0J8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tbc1d2bQ3U0J8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tbc1d2bQ3U0J8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tbc1d2bQ3U0J8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tbc1d2bQ3U0J8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tbc1d2bQ3U0J8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tbc1d2bQ3U0J8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tbc1d2bQ3U0J8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tbc1d2bQ3U0J8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tbc1d2bQ3U0J8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tbc1d2bQ3U0J8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tbc1d2bQ3U0J8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tbc1d2bQ3U0J8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.9 ms