Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrn4clQ3TYX2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrn4clQ3TYX2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrn4clQ3TYX2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrn4clQ3TYX2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrn4clQ3TYX2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrn4clQ3TYX2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrn4clQ3TYX2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrn4clQ3TYX2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrn4clQ3TYX2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrn4clQ3TYX2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrn4clQ3TYX2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrn4clQ3TYX2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrn4clQ3TYX2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrn4clQ3TYX2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrn4clQ3TYX2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrn4clQ3TYX2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrn4clQ3TYX2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrn4clQ3TYX2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrn4clQ3TYX2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrn4clQ3TYX2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrn4clQ3TYX2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrn4clQ3TYX2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrn4clQ3TYX2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrn4clQ3TYX2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrn4clQ3TYX2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrn4clQ3TYX2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrn4clQ3TYX2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrn4clQ3TYX2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrn4clQ3TYX2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrn4clQ3TYX2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrn4clQ3TYX2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrn4clQ3TYX2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrn4clQ3TYX2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrn4clQ3TYX2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrn4clQ3TYX2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrn4clQ3TYX2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrn4clQ3TYX2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrn4clQ3TYX2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrn4clQ3TYX2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrn4clQ3TYX2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrn4clQ3TYX2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrn4clQ3TYX2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrn4clQ3TYX2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrn4clQ3TYX2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrn4clQ3TYX2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrn4clQ3TYX2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrn4clQ3TYX2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrn4clQ3TYX2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrn4clQ3TYX2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrn4clQ3TYX2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrn4clQ3TYX2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrn4clQ3TYX2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrn4clQ3TYX2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrn4clQ3TYX2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrn4clQ3TYX2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrn4clQ3TYX2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrn4clQ3TYX2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrn4clQ3TYX2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrn4clQ3TYX2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrn4clQ3TYX2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrn4clQ3TYX2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrn4clQ3TYX2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrn4clQ3TYX2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrn4clQ3TYX2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrn4clQ3TYX2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrn4clQ3TYX2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrn4clQ3TYX2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrn4clQ3TYX2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrn4clQ3TYX2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrn4clQ3TYX2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrn4clQ3TYX2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrn4clQ3TYX2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrn4clQ3TYX2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrn4clQ3TYX2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrn4clQ3TYX2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrn4clQ3TYX2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrn4clQ3TYX2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrn4clQ3TYX2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrn4clQ3TYX2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrn4clQ3TYX2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrn4clQ3TYX2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrn4clQ3TYX2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrn4clQ3TYX2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrn4clQ3TYX2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrn4clQ3TYX2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrn4clQ3TYX2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrn4clQ3TYX2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrn4clQ3TYX2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrn4clQ3TYX2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms