Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXS7

Psmd1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd1Q3TXS7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Psmd1Q3TXS7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Psmd1Q3TXS7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Psmd1Q3TXS7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Psmd1Q3TXS7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Psmd1Q3TXS7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Psmd1Q3TXS7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Psmd1Q3TXS7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Psmd1Q3TXS7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Psmd1Q3TXS7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Psmd1Q3TXS7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Psmd1Q3TXS7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Psmd1Q3TXS7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Psmd1Q3TXS7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Psmd1Q3TXS7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Psmd1Q3TXS7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Psmd1Q3TXS7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Psmd1Q3TXS7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Psmd1Q3TXS7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Psmd1Q3TXS7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Psmd1Q3TXS7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Psmd1Q3TXS7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Psmd1Q3TXS7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Psmd1Q3TXS7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Psmd1Q3TXS7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Psmd1Q3TXS7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Psmd1Q3TXS7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Psmd1Q3TXS7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Psmd1Q3TXS7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Psmd1Q3TXS7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Psmd1Q3TXS7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Psmd1Q3TXS7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Psmd1Q3TXS7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Psmd1Q3TXS7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Psmd1Q3TXS7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Psmd1Q3TXS7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Psmd1Q3TXS7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Psmd1Q3TXS7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Psmd1Q3TXS7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Psmd1Q3TXS7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Psmd1Q3TXS7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Psmd1Q3TXS7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Psmd1Q3TXS7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Psmd1Q3TXS7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Psmd1Q3TXS7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Psmd1Q3TXS7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Psmd1Q3TXS7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Psmd1Q3TXS7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Psmd1Q3TXS7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Psmd1Q3TXS7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Psmd1Q3TXS7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Psmd1Q3TXS7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Psmd1Q3TXS7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Psmd1Q3TXS7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Psmd1Q3TXS7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Psmd1Q3TXS7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Psmd1Q3TXS7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Psmd1Q3TXS7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Psmd1Q3TXS7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Psmd1Q3TXS7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Psmd1Q3TXS7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Psmd1Q3TXS7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Psmd1Q3TXS7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Psmd1Q3TXS7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Psmd1Q3TXS7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Psmd1Q3TXS7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Psmd1Q3TXS7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Psmd1Q3TXS7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Psmd1Q3TXS7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Psmd1Q3TXS7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Psmd1Q3TXS7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Psmd1Q3TXS7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Psmd1Q3TXS7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Psmd1Q3TXS7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Psmd1Q3TXS7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Psmd1Q3TXS7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Psmd1Q3TXS7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Psmd1Q3TXS7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Psmd1Q3TXS7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Psmd1Q3TXS7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Psmd1Q3TXS7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Psmd1Q3TXS7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Psmd1Q3TXS7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Psmd1Q3TXS7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Psmd1Q3TXS7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Psmd1Q3TXS7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Psmd1Q3TXS7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Psmd1Q3TXS7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Psmd1Q3TXS7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Psmd1Q3TXS7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Psmd1Q3TXS7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Psmd1Q3TXS7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Psmd1Q3TXS7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Psmd1Q3TXS7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Psmd1Q3TXS7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Psmd1Q3TXS7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Psmd1Q3TXS7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Psmd1Q3TXS7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Psmd1Q3TXS7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Psmd1Q3TXS7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms